71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2051 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  34.62 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  34.24 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.65 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  36.02 
 
 		 299 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  30.71 
 
 		 280 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  32.17 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.84 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.53 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  30.28 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.8 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  31.3 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  30.53 
 
 		 298 aa  88.6  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.63 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  29.32 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  26.45 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  27.8 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  29.31 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  27.78 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  26.67 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  30.94 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.68 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  26.23 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  24.81 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.17 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.02 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.02 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  29.15 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.9 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  29.92 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.75 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  26.67 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.32 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  26.79 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  24.88 
 
 		 597 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  23.77 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.25 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  27.43 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  25.13 
 
 		 558 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  25 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  22.54 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  25.3 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  29.15 
 
 		 513 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  29.85 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  25 
 
 		 622 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.49 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  25.25 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1439  hypothetical protein  24.09 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  24 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  25.38 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  24.12 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.46 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5584  protein of unknown function DUF324  23.58 
 
 		 649 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  26.94 
 
 		 415 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  24.18 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  26.69 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.63 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1149  hypothetical protein  21.65 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0538158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  26.8 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  24.06 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2351  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  50 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0217  Csm3 family CRISPR-associated RAMP protein  27.46 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5588  protein of unknown function DUF324  21.19 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.53 
 
 		 278 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1162  hypothetical protein  23.76 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  22.37 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  22.41 
 
 		 390 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2054  hypothetical protein  26.87 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1752  hypothetical protein  42.62 
 
 		 380 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0368  hypothetical protein  24.14 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  34.48 
 
 		 321 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>