More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0362 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  316  7.999999999999999e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  74.84 
 
 		 159 aa  245  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 160 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  71.25 
 
 		 160 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  59.09 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  56.21 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  58.62 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 160 aa  170  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  51.57 
 
 		 160 aa  170  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  54.29 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  52.29 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  51.63 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  51.63 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  51.63 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 162 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  51.61 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  29.2 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  30.43 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  31.03 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  30.77 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  30.77 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  30.77 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  30.77 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  30.77 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  30.77 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.43 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>