46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3514 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1151    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  37.93 
 
 		 582 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  37.61 
 
 		 606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  31.02 
 
 		 619 aa  93.6  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  32.45 
 
 		 712 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  24.86 
 
 		 588 aa  60.1  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  39.45 
 
 		 515 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.82 
 
 		 652 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  42.31 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  33.64 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  35.35 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  44.9 
 
 		 452 aa  50.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  37.88 
 
 		 439 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  41.38 
 
 		 457 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  37.8 
 
 		 251 aa  47.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  36.54 
 
 		 695 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  32.61 
 
 		 444 aa  47.4  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  31.52 
 
 		 976 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  31.94 
 
 		 464 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  36.78 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  32.35 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  27.36 
 
 		 709 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  32.11 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  38.46 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  29.47 
 
 		 769 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  40.85 
 
 		 596 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  35.06 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  22.88 
 
 		 736 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  36.62 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  28.46 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  36.46 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  36.67 
 
 		 410 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  35 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  27.12 
 
 		 601 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  29.25 
 
 		 607 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  29.21 
 
 		 509 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  39.74 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  35 
 
 		 429 aa  44.3  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  32.56 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  36.11 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  28.46 
 
 		 423 aa  43.9  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  38.24 
 
 		 598 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  28 
 
 		 608 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  32.29 
 
 		 445 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  33.72 
 
 		 449 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>