More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2423 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  100 
 
 		 437 aa  871    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  42.44 
 
 		 448 aa  352  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  37.09 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  39.11 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.36 
 
 		 477 aa  272  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  36.17 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.66 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  36.81 
 
 		 480 aa  269  8.999999999999999e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  34.21 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  34.21 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  34.21 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  34.21 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  34.21 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  34.21 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  34.01 
 
 		 491 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.6 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  36.28 
 
 		 468 aa  259  6e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.76 
 
 		 466 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  33.74 
 
 		 491 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  34.68 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.91 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  33.82 
 
 		 468 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  32.06 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  32.96 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  31.1 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  33.62 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  33.26 
 
 		 482 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  35.05 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  31.74 
 
 		 477 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.7 
 
 		 457 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  33.62 
 
 		 468 aa  240  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  32.07 
 
 		 452 aa  239  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  31.9 
 
 		 472 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  31.9 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  34.9 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  31.9 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.48 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  31.9 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  34.29 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  32.11 
 
 		 472 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  32.11 
 
 		 472 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  34.76 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  32.11 
 
 		 472 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  32.11 
 
 		 472 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  32.11 
 
 		 472 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  31.9 
 
 		 472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  31.9 
 
 		 472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  31.9 
 
 		 472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  33.33 
 
 		 472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  31.9 
 
 		 472 aa  236  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  32.52 
 
 		 491 aa  236  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  33.4 
 
 		 499 aa  236  8e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  31.9 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.69 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  34.51 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  33.69 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.69 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  30.84 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  34.15 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  33.26 
 
 		 482 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  34.3 
 
 		 544 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.12 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  35.04 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  31.5 
 
 		 524 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  33.41 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  32.48 
 
 		 466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  32.01 
 
 		 480 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  34.48 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  34.12 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  35.33 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  32.33 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  32.96 
 
 		 475 aa  223  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  31.14 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  31.99 
 
 		 480 aa  220  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  33.7 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  34.52 
 
 		 465 aa  219  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  29.61 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  31.21 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  31.89 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.62 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  32.99 
 
 		 504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  30.28 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.55 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.55 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  33.19 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.55 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  32.46 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  33.84 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.37 
 
 		 480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  33.99 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  33.55 
 
 		 464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  33.55 
 
 		 473 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>