238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2223 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 200 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  45.13 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  47.18 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  47.85 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  44.44 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  48.21 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  41.57 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  41.99 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  41.28 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.16 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  35.64 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  37.14 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  43.15 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  37.36 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8747  predicted protein  48.28 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.336863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.15 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  35.56 
 
 		 213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  37.14 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  31.84 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  42.47 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  41.78 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  42.47 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  42.47 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  42.47 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  42.47 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  42.47 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  42.47 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  38.75 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  36.52 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  42.47 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.76 
 
 		 290 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  38.24 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  42.28 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  34.39 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  35.84 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  33.53 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  33.51 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  34.95 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  32.57 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  36.25 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  33.52 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  44.44 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  38.73 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  34.66 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  32.81 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  34.88 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  34.66 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  32.57 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  34.66 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  31.38 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  34.46 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  31.22 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  31.55 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  34.04 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  36.13 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  32.95 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0142  protein of unknown function UPF0029  31.82 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  38.03 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  34.3 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  34.2 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  32.63 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.67 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  42.52 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  44.17 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  36.91 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  31.98 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  33.55 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  31.85 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  43.55 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  37.25 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  32.8 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  35.92 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  32.8 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  40.44 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  41.73 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  32.8 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  35.95 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  35.03 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  34.88 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  34.88 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  29.88 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0770  hypothetical protein  33.76 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  43.7 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  41.18 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  34.88 
 
 		 303 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  33.33 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  34.88 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  34.88 
 
 		 303 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  29.94 
 
 		 203 aa  98.2  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  30.67 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  36.88 
 
 		 198 aa  98.2  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  37.91 
 
 		 303 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  34.01 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  36.76 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  34.69 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  32.74 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>