More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1805 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  73.36 
 
 		 640 aa  955    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  60.1 
 
 		 641 aa  729    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  58.02 
 
 		 634 aa  710    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  59.69 
 
 		 647 aa  728    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 610 aa  1258    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  55.73 
 
 		 646 aa  738    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  58.18 
 
 		 643 aa  731    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  38.71 
 
 		 615 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.76 
 
 		 642 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  37.52 
 
 		 643 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  36.98 
 
 		 634 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  37.82 
 
 		 645 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  37.52 
 
 		 647 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.74 
 
 		 639 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  37.25 
 
 		 619 aa  357  3.9999999999999996e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 		 636 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  35.13 
 
 		 657 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  35.95 
 
 		 648 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 		 636 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  35.57 
 
 		 801 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 		 646 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.06 
 
 		 574 aa  347  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.07 
 
 		 651 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  34.85 
 
 		 596 aa  342  1e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 		 766 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 678 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  36.78 
 
 		 640 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 793 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 		 703 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 		 679 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  35.03 
 
 		 801 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  35.03 
 
 		 801 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 		 673 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 618 aa  332  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 		 645 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.27 
 
 		 643 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 600 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  35.3 
 
 		 621 aa  330  6e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 		 618 aa  330  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 		 618 aa  330  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 683 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 		 618 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 		 662 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 		 637 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  36.15 
 
 		 664 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.21 
 
 		 618 aa  327  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.26 
 
 		 618 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 607 aa  326  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 		 646 aa  325  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 635 aa  324  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  36.49 
 
 		 681 aa  324  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 		 767 aa  324  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 		 691 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 		 664 aa  323  5e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  34.08 
 
 		 771 aa  323  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.43 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 627 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  34.75 
 
 		 622 aa  322  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 		 609 aa  319  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  32.96 
 
 		 650 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  32.43 
 
 		 661 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 		 635 aa  316  7e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  34.27 
 
 		 586 aa  316  8e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  34.03 
 
 		 802 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 630 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 		 610 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.08 
 
 		 611 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 		 610 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 		 618 aa  312  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  33.44 
 
 		 803 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 809 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  34.39 
 
 		 627 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 803 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 		 802 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 		 802 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 		 802 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 		 802 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  34.88 
 
 		 619 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  33.85 
 
 		 640 aa  309  8e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 		 655 aa  309  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 		 602 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  34.85 
 
 		 681 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 630 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  33.07 
 
 		 800 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 		 648 aa  307  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 632 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 618 aa  307  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  32 
 
 		 602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  32 
 
 		 602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 633 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 		 646 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 646 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.9 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  34.95 
 
 		 669 aa  302  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  33.73 
 
 		 646 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>