167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1269 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1269  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 		 436 aa  910    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00492454  normal  0.0230075 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11161  phosphatidylserine decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01730)  50.11 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4108  phosphatidylserine decarboxylase-related  48.55 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08120  Phosphatidylserine decarboxylase, putative  45.8 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0076  putative phosphatidylserine decarboxylase  43.75 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.946324  hitchhiker  0.00170285 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1997  putative phosphatidylserine decarboxylase  43.85 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1018  putative phosphatidylserine decarboxylase  43.85 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1306  putative phosphatidylserine decarboxylase  43.85 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3176  putative phosphatidylserine decarboxylase  43.85 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2283  putative phosphatidylserine decarboxylase  43.85 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.808737  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3048  putative phosphatidylserine decarboxylase  43.96 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.65507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1394  phosphatidylserine decarboxylase precursor  43.7 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5255  phosphatidylserine decarboxylase-related  42.3 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410798 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5484  phosphatidylserine decarboxylase-related  40.55 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459221 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6081  phosphatidylserine decarboxylase-related  42.05 
 
 		 416 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134121 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6491  phosphatidylserine decarboxylase-related  41.79 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00510821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1338  phosphatidylserine decarboxylase-related  41.54 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6332  phosphatidylserine decarboxylase-related  39.75 
 
 		 415 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0687307 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5602  phosphatidylserine decarboxylase-related  39.5 
 
 		 415 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4860  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  34.87 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0399088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0966  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.01 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0979  phosphatidylserine decarboxylase-related  34.38 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3578  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  31.66 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142154  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07385  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  30.96 
 
 		 1264 aa  97.1  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20791  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  27.24 
 
 		 1064 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  27.93 
 
 		 1053 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1772  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  28.64 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.839794  normal  0.123461 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  26.81 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  26.65 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  27.16 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  29.21 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1551  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.16 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  0.0668406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  27.15 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  27.66 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  25.75 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  26.99 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 		 254 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  25.32 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  25.3 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  26.02 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  27.56 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  26.69 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  27.11 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  24.68 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  25.09 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  25.09 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  25.6 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  22.83 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  25.91 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  27.97 
 
 		 291 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  25.29 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  24.61 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  25.28 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  27.4 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  25.62 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  23.21 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  24.07 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 292 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  27.17 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  27.14 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  24.74 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  26.97 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  25.73 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  23.68 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  25.74 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  26.12 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  25.23 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  23.81 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  24.5 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4622  phosphatidylserine decarboxylase  23.5 
 
 		 292 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 289 aa  57  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  22.3 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  25.39 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  26.56 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  25.58 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  21.79 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  22.75 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  25.55 
 
 		 296 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  27.97 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  23.61 
 
 		 287 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>