178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4622 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4622  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 292 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4806  phosphatidylserine decarboxylase  85.07 
 
 		 291 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0342  phosphatidylserine decarboxylase  68.04 
 
 		 303 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3604  phosphatidylserine decarboxylase  65.26 
 
 		 290 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0699  phosphatidylserine decarboxylase  61.62 
 
 		 297 aa  371  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6208  putative phosphatidylserine decarboxylase  61.19 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000986716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  33.22 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  31.97 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  31.97 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  31.97 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  31.97 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  32.34 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  30.88 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  34.67 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  32.07 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  31.72 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  31.72 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  30.14 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  31.47 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  31.16 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  30.82 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  32.34 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  31.27 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  32.73 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  32.73 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  34.08 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  35.07 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  31.56 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  31.01 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  31.14 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  31.14 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  30.69 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  30.4 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  35.71 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  34.98 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  30.42 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  31.43 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  32.62 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  33.7 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  32.31 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  33.69 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  32.49 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  35.08 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  31.69 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  33.68 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  34.96 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  32.73 
 
 		 288 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  30.48 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  30.48 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  30.48 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  33.09 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  30.07 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  30.26 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  33.71 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  34.21 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  33.21 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  32.13 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  35.34 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  31.47 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0779  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00256748 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  31.47 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4458  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.183359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  29.89 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  27.56 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  30.38 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  33.09 
 
 		 283 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  31.62 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  27.56 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4083  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 610 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4360  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4471  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  31.62 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  29.26 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  31.25 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  30.39 
 
 		 613 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  31.21 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  29.04 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  29.58 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  29.89 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  32.33 
 
 		 282 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  30.51 
 
 		 325 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>