More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2460 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  88.92 
 
 		 379 aa  716    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  78.57 
 
 		 380 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  81.27 
 
 		 379 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  88.92 
 
 		 379 aa  718    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 379 aa  788    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  44.8 
 
 		 384 aa  363  4e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  44.8 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  44.06 
 
 		 379 aa  355  8.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  43.24 
 
 		 380 aa  348  1e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  41.91 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  44.18 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  40.05 
 
 		 382 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  43.16 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  43.16 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  41.69 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  44.01 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  40.84 
 
 		 383 aa  305  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  42.59 
 
 		 381 aa  305  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  42.11 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  42.89 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  42.82 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  41.29 
 
 		 384 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  41.29 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  39.47 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.66 
 
 		 387 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  40.44 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.9 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  39.53 
 
 		 385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  40.21 
 
 		 385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  38.62 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  42.36 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  38.36 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  39.12 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  42.63 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  39.21 
 
 		 382 aa  274  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  41.11 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.74 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  40.52 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  37.37 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  41.04 
 
 		 391 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.04 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.95 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.53 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.5 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  40.55 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.67 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  40.26 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  40.55 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  38.03 
 
 		 412 aa  262  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  39.64 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.94 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  37.28 
 
 		 402 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  38.06 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  39.66 
 
 		 374 aa  257  3e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  36.19 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  41.83 
 
 		 394 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  34.73 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  34.64 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  35.89 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  35.89 
 
 		 406 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  35.79 
 
 		 415 aa  242  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  35.19 
 
 		 415 aa  242  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  35.36 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  36.16 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  34.04 
 
 		 398 aa  238  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  34.81 
 
 		 406 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  34.3 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  35.73 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  35.23 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.22 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  40.37 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  36.89 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  34.12 
 
 		 401 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  35.24 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.14 
 
 		 380 aa  235  8e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  35.37 
 
 		 421 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  38.77 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  36.34 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  33.97 
 
 		 406 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  33.86 
 
 		 396 aa  232  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  32.72 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  34.45 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  33.93 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  34.19 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  34.2 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  32.03 
 
 		 414 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  34.97 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  34.38 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  34.26 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  33.25 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  35.29 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  32.13 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  34.49 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  33.51 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  37.73 
 
 		 390 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1929  aminotransferase class V  37.25 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>