More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0489 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  100 
 
 		 332 aa  671    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  73.19 
 
 		 333 aa  461  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  67.67 
 
 		 333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  66.46 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  62.08 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  66.16 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.31 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.35 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  64.18 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  55.96 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  56.4 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  55.26 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  53.35 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.99 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  55.66 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.98 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  52.58 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  53.7 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.77 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  49.69 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.01 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  48.34 
 
 		 341 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50 
 
 		 338 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.49 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  48.93 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.33 
 
 		 350 aa  282  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.04 
 
 		 369 aa  282  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.49 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.43 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  46.13 
 
 		 407 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  47.46 
 
 		 434 aa  279  5e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.17 
 
 		 343 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  45.82 
 
 		 407 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  45.45 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.48 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.75 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  45.82 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  47.75 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.16 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 364 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  48.79 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  44.71 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  46.99 
 
 		 406 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  47.73 
 
 		 373 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  52.72 
 
 		 366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  46.69 
 
 		 406 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  45.65 
 
 		 407 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  45.7 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.79 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  46.75 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  46.99 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.48 
 
 		 435 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  46.93 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  47.56 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  47.31 
 
 		 370 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.3 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.4 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.57 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  43.81 
 
 		 408 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  43.81 
 
 		 408 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  43.81 
 
 		 408 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  47.45 
 
 		 352 aa  271  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  46.83 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.46 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  47.06 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  45.73 
 
 		 402 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.71 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  47.15 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  47.65 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  46.65 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 372 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.38 
 
 		 437 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  47.13 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.51 
 
 		 482 aa  268  7e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.88 
 
 		 458 aa  268  7e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  47.68 
 
 		 365 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  46.39 
 
 		 353 aa  268  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  45.65 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.97 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  45.1 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  46.25 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  46.22 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  46.93 
 
 		 353 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  47.43 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  46.79 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  45.35 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.74 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>