157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1262 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1262  small GTP-binding protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000054589  decreased coverage  0.00000000022616 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0253  protein of unknown function, ATP binding  45.18 
 
 
182 aa  137  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0080  small GTP-binding protein  39.88 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0120715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2799  small GTP-binding protein  39.29 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0639382  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1730  small GTP-binding protein  37.28 
 
 
176 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2141  small GTP-binding protein  37.28 
 
 
176 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1323  small GTP-binding protein  37.72 
 
 
193 aa  121  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.415004  normal  0.083818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0846  small GTP-binding protein  36.31 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3230  small GTP-binding protein  37.28 
 
 
177 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.137976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4502  small GTP-binding protein  34.1 
 
 
172 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.475752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3915  protein of unknown function, ATP binding  35.5 
 
 
177 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0760  putative ATP/GTP-binding protein  34.86 
 
 
196 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0379  small GTP-binding protein  34.39 
 
 
191 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24580  predicted GTPase  35.59 
 
 
204 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5269  hypothetical protein  35.91 
 
 
197 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0641  protein of unknown function, ATP binding  35.84 
 
 
198 aa  101  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.437609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5416  protein of unknown function ATP binding  33.33 
 
 
195 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3340  protein of unknown function ATP binding protein  35.96 
 
 
193 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.294578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0275  protein of unknown function ATP binding protein  34.44 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.955762  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0461  protein of unknown function ATP binding  34.46 
 
 
202 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13398  ATP/GTP-binding protein  35.09 
 
 
193 aa  99  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00758  normal  0.0959612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5473  protein of unknown function ATP binding  36.53 
 
 
204 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  0.984202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3225  protein of unknown function ATP binding  33.85 
 
 
201 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0977  hypothetical protein  38.15 
 
 
208 aa  97.8  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.235397  normal  0.429497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5993  protein of unknown function ATP binding  34.68 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222654  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3196  GTPase-like protein  32.63 
 
 
207 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0816  protein of unknown function ATP binding protein  33.85 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0322936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02280  predicted GTPase  33.33 
 
 
197 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.650431  normal  0.614387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3252  hypothetical protein  32.78 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129642  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3811  protein of unknown function ATP binding protein  33.52 
 
 
197 aa  95.5  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1791  hypothetical protein  33.71 
 
 
195 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3607  protein of unknown function ATP binding protein  33.14 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7865  protein of unknown function ATP binding  34.68 
 
 
202 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01160  small GTP-binding protein domain protein  39.58 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2447  putative ATP/GTP-binding protein  33.15 
 
 
195 aa  94.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1811  hypothetical protein  34.09 
 
 
179 aa  94.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0943  putative ATP/GTP-binding protein  34.97 
 
 
195 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1192  protein of unknown function, ATP binding protein  34.5 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1209  protein of unknown function, ATP binding  34.5 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.762798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1219  protein of unknown function, ATP binding  34.5 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3596  protein of unknown function, ATP binding  33.71 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5489  protein of unknown function ATP binding  32.77 
 
 
206 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448291  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3316  protein of unknown function ATP binding  32.37 
 
 
195 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1824  hypothetical protein  35.26 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2006  protein of unknown function ATP binding  32.37 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.959688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0973  hypothetical protein  34.59 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  0.248176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0763  protein of unknown function ATP binding  33.33 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0366  protein of unknown function ATP binding  33.71 
 
 
211 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2401  protein of unknown function ATP binding  31.91 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.37736  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3802  protein of unknown function ATP binding protein  34.46 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.575457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2857  protein of unknown function, ATP binding  34.3 
 
 
206 aa  92  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3977  protein of unknown function ATP binding  33.15 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0819  protein of unknown function, ATP binding  32.77 
 
 
203 aa  91.3  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3051  protein of unknown function ATP binding protein  30.9 
 
 
198 aa  91.3  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4263  protein of unknown function ATP binding  32.37 
 
 
205 aa  91.3  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0218869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0174  protein of unknown function ATP binding protein  32.26 
 
 
310 aa  91.3  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37500  predicted GTPase  35.47 
 
 
190 aa  90.9  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.287948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1148  hypothetical protein  34.68 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371751  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5185  protein of unknown function ATP binding  32.37 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.729225  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4886  protein of unknown function, ATP binding  35.67 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5992  normal  0.0181219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0313  protein of unknown function ATP binding  32.12 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0533217  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0275  protein of unknown function ATP binding  32.26 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.550996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2803  protein of unknown function ATP binding protein  34.64 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000564845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5250  protein of unknown function ATP binding  31.03 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1430  putative ATP/GTP-binding protein  31.52 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1292  protein of unknown function ATP binding  32.42 
 
 
203 aa  89  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980215  hitchhiker  0.00348486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34260  predicted GTPase  31.72 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.63353  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0153  hypothetical protein  32.22 
 
 
191 aa  88.2  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2448  protein of unknown function ATP binding  35.26 
 
 
194 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3666  protein of unknown function ATP binding protein  33.14 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0492  protein of unknown function ATP binding protein  36.05 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2047  putative ATP/GTP-binding protein  31.87 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0359  protein of unknown function ATP binding protein  30.05 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635716  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01830  predicted GTPase  32.39 
 
 
189 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3872  protein of unknown function, ATP binding  31.21 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.21835  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3042  small GTP-binding protein  30.73 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1539  protein of unknown function, ATP binding  36.42 
 
 
188 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2531  protein of unknown function ATP binding  36.51 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4183  protein of unknown function ATP binding  31.32 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.578204  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2387  protein of unknown function ATP binding  32.56 
 
 
207 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4813  protein of unknown function ATP binding  31.93 
 
 
202 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06970  predicted GTPase  30.86 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0253092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3123  protein of unknown function ATP binding protein  31.43 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3172  protein of unknown function ATP binding protein  31.25 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216462  normal  0.253397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2752  protein of unknown function ATP binding protein  30.05 
 
 
218 aa  85.1  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0656  small GTP-binding protein  36.36 
 
 
178 aa  85.1  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33540  predicted GTPase  31.55 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168507  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2069  protein of unknown function ATP binding  31.21 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2206  small GTP-binding protein  35.48 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  normal  0.0744426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1806  protein of unknown function ATP binding protein  30.73 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110416  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2576  small GTP-binding protein  35.48 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2804  putative ATP/GTP-binding protein  31.98 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2203  protein of unknown function ATP binding protein  31.93 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  hitchhiker  0.000213997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3845  protein of unknown function ATP binding  31.79 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0457  small GTP-binding protein  40.86 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0486938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0133  ATP binding protein  32.12 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1434  protein of unknown function ATP binding protein  28.79 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0392  protein of unknown function ATP binding  35.11 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.494311  normal  0.506956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0776  protein of unknown function ATP binding  31.71 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2067  small GTP-binding protein  30.72 
 
 
387 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.66233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>