More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3537 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
237 aa  465  1e-130  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.47 
 
 
243 aa  348  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  67.97 
 
 
233 aa  302  3e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  63.56 
 
 
251 aa  297  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  62.13 
 
 
265 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  62.13 
 
 
265 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  63.64 
 
 
297 aa  293  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  60.83 
 
 
246 aa  292  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  61.09 
 
 
248 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  63.4 
 
 
251 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 
263 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 
263 aa  287  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 
263 aa  287  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  60.08 
 
 
246 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  60.08 
 
 
246 aa  285  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  61.6 
 
 
251 aa  283  1e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  59.92 
 
 
251 aa  281  6e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  66.08 
 
 
230 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  4.63151e-06 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  58.05 
 
 
251 aa  274  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  59.91 
 
 
244 aa  273  2e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  59.91 
 
 
244 aa  273  2e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  63.72 
 
 
240 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.47 
 
 
232 aa  265  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.59 
 
 
239 aa  253  3e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.78 
 
 
222 aa  247  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 
231 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 
231 aa  228  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.19 
 
 
232 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.28 
 
 
229 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 
230 aa  221  5e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.03 
 
 
265 aa  219  2e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  48.73 
 
 
250 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
235 aa  207  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 
244 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.27 
 
 
248 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 
234 aa  201  1e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.72711e-18 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 
227 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  46.53 
 
 
250 aa  197  1e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.35 
 
 
239 aa  197  1e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.11905e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 
229 aa  196  2e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  51.53 
 
 
232 aa  195  4e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
228 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 
261 aa  194  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
227 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.9 
 
 
239 aa  193  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 
234 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 
235 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  50.22 
 
 
228 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
235 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 
225 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 
230 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 
225 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 
229 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
229 aa  189  3e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.58 
 
 
254 aa  189  3e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  189  3e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.34523e-07  hitchhiker  3.23141e-12 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 
235 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 
224 aa  188  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 
227 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 
229 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 
224 aa  188  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
227 aa  188  6e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  188  6e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  188  6e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.54 
 
 
235 aa  188  6e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.54 
 
 
235 aa  188  6e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  188  6e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  44.74 
 
 
225 aa  188  6e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  188  6e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.54 
 
 
235 aa  188  6e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 
230 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 
231 aa  187  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  4.30064e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 
225 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 
235 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 
225 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  43.86 
 
 
226 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 
231 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  39.82 
 
 
233 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 
233 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 
238 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 
225 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
236 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  39.82 
 
 
233 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.37 
 
 
223 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
233 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 
234 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
229 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 
228 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 
239 aa  185  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 
228 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.25 
 
 
264 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  48.05 
 
 
241 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
237 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 
225 aa  185  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 
232 aa  184  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 
230 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.06 
 
 
231 aa  184  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 
225 aa  184  1e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.6 
 
 
235 aa  184  1e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>