More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 288 aa  583  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  59.11 
 
 		 288 aa  323  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  57.93 
 
 		 286 aa  300  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  47.42 
 
 		 290 aa  258  6e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 311 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  47.12 
 
 		 310 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  46.21 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  47.92 
 
 		 303 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.76 
 
 		 286 aa  231  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  47.22 
 
 		 279 aa  228  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  44.41 
 
 		 277 aa  228  9e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  46.37 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  47 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.9 
 
 		 303 aa  225  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  46.13 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  47.12 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  44.06 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.21 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  47.22 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  41.69 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  48.31 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  46.88 
 
 		 303 aa  214  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  46.74 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  42.28 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  43.73 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.07 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.16 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  40.96 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  42.18 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  42.95 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  40.97 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  43.73 
 
 		 308 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  41.44 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  42.76 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  42.16 
 
 		 291 aa  208  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  45.61 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  44.83 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  46.13 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  41.5 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  40.82 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  45.36 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  41.24 
 
 		 292 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  43.39 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  46.07 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.55 
 
 		 292 aa  201  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  43.71 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.87 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  44.22 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  40.62 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  39.66 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  40.28 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  44.48 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  38.91 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  46.42 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  44.15 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  44.91 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  40.14 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  43.71 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  46.04 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  44.53 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  38.64 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  43.2 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  43.7 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  43.54 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  45.52 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  44.53 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  44.53 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  37.97 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  44.78 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  42.66 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  43.77 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  43.16 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>