More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04430 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 440 aa  908    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 457 aa  624  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0403  histidyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 420 aa  360  3e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 421 aa  360  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 423 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 415 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 416 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 414 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 424 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 419 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 416 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 417 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 423 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 418 aa  342  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  44.11 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 426 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 420 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 413 aa  332  9e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  41.15 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 414 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 419 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 419 aa  329  6e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 420 aa  329  6e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 413 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 441 aa  325  7e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  40.89 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 424 aa  325  9e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 421 aa  320  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 422 aa  319  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 418 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  40.79 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 419 aa  316  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 426 aa  316  6e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 424 aa  315  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 400 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 417 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 428 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 418 aa  311  1e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 446 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 415 aa  310  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 424 aa  309  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>