More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0807 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  59.1 
 
 
625 aa  781    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
613 aa  1266    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  49.43 
 
 
615 aa  601  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  48.24 
 
 
628 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  47.17 
 
 
620 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  47.01 
 
 
620 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  44.89 
 
 
624 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  45.51 
 
 
607 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  44.65 
 
 
593 aa  545  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  45.64 
 
 
588 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  42.93 
 
 
613 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  43.68 
 
 
616 aa  510  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  41.72 
 
 
653 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  41.21 
 
 
685 aa  485  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  39.15 
 
 
607 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  40.71 
 
 
641 aa  477  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  43.25 
 
 
591 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 
607 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  38.5 
 
 
607 aa  474  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  40.8 
 
 
622 aa  468  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  39.65 
 
 
614 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  42.11 
 
 
590 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  41.65 
 
 
594 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  41.49 
 
 
594 aa  458  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 
594 aa  458  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  39.77 
 
 
601 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  41.17 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  41.07 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  41.17 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  41.17 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 
591 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  41.23 
 
 
594 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.32 
 
 
604 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  41.17 
 
 
594 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  41.17 
 
 
594 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  41.6 
 
 
613 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  40.52 
 
 
596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  38.78 
 
 
669 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  38.65 
 
 
638 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  38.67 
 
 
665 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.13 
 
 
610 aa  432  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  36.42 
 
 
649 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.03 
 
 
615 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  38.54 
 
 
622 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
656 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  35.88 
 
 
671 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 
658 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  37.62 
 
 
708 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.56 
 
 
624 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 
617 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.66 
 
 
617 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  36.68 
 
 
658 aa  420  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  37.86 
 
 
598 aa  422  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  37.77 
 
 
594 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.78 
 
 
627 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  36.51 
 
 
611 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  38.75 
 
 
593 aa  412  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  35.79 
 
 
679 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  38.27 
 
 
595 aa  413  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  37.64 
 
 
593 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  36.46 
 
 
678 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  37.64 
 
 
593 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 
676 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 
676 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 
666 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 
676 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  36.25 
 
 
678 aa  412  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  34.99 
 
 
665 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  36.22 
 
 
643 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  35.04 
 
 
692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 
660 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  35.99 
 
 
625 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 
641 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 
613 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  34.63 
 
 
675 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 
619 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  37 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  35.43 
 
 
647 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  36.04 
 
 
644 aa  401  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  35.85 
 
 
616 aa  402  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  35.57 
 
 
646 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  36.22 
 
 
663 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  35.37 
 
 
612 aa  399  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  34.26 
 
 
693 aa  399  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 
609 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  34.29 
 
 
670 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 
643 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  35.56 
 
 
684 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  35.35 
 
 
629 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  36.42 
 
 
631 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  34.93 
 
 
636 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  33.53 
 
 
705 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 
610 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  35.61 
 
 
635 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  36.2 
 
 
644 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  35.66 
 
 
651 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 
626 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 
613 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  35.09 
 
 
737 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 
652 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>