More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0044 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
538 aa  1102    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  66.91 
 
 
541 aa  760    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  49.05 
 
 
535 aa  519  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  45.91 
 
 
535 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  44.74 
 
 
542 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  45.66 
 
 
534 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  42.4 
 
 
552 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  44.63 
 
 
534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  45.49 
 
 
530 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  40.53 
 
 
538 aa  435  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  42.24 
 
 
544 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  40.67 
 
 
534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  41.48 
 
 
531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  39.45 
 
 
545 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  40.75 
 
 
533 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 
550 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1803  extracellular solute-binding protein family 5  38.19 
 
 
537 aa  398  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  40.11 
 
 
534 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  38.95 
 
 
541 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  39.85 
 
 
536 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2170  extracellular solute-binding protein family 5  39.85 
 
 
535 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  40.39 
 
 
536 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  37.68 
 
 
543 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  35.79 
 
 
535 aa  330  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  36.11 
 
 
544 aa  326  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  34.01 
 
 
535 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  36.16 
 
 
547 aa  322  8e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  36.77 
 
 
547 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.92 
 
 
545 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 
545 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.64 
 
 
536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.45 
 
 
536 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  36.92 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  36.09 
 
 
555 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.32 
 
 
536 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 
533 aa  312  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  36.9 
 
 
545 aa  312  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.82 
 
 
536 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.88 
 
 
536 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  36.11 
 
 
543 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 
536 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  36.21 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01307  murein tripeptide (L-ala-gamma-D-glutamyl-meso-DAP) transporter subunit  36.96 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.466837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01317  hypothetical protein  36.96 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.441272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2316  extracellular solute-binding protein family 5  36.96 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.64 
 
 
536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1542  periplasmic murein peptide-binding protein  36.96 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1569  periplasmic murein peptide-binding protein  36.96 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2295  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.64 
 
 
536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1446  periplasmic murein peptide-binding protein  36.96 
 
 
537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
525 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  35.14 
 
 
543 aa  306  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.31 
 
 
558 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  36.31 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.31 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.91 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  36.31 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  36.31 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.31 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.31 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.91 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  35.26 
 
 
554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.91 
 
 
543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  35.91 
 
 
543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  33.64 
 
 
530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  36.08 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1977  periplasmic murein peptide-binding protein  36.76 
 
 
537 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.526776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  36.31 
 
 
558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 
533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 
545 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  36.11 
 
 
543 aa  303  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2219  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.79 
 
 
550 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4438  extracellular solute-binding protein family 5  34.66 
 
 
538 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.829261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 
544 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  35.98 
 
 
537 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.43 
 
 
525 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
538 aa  300  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  33.6 
 
 
525 aa  299  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0757  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  33.65 
 
 
538 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 
542 aa  299  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  35.98 
 
 
537 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  35.98 
 
 
537 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2438  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 
526 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  35.98 
 
 
537 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  35.79 
 
 
537 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  34.75 
 
 
536 aa  297  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4505  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 
538 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.347947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  35.03 
 
 
556 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
532 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  35.56 
 
 
556 aa  296  7e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2286  extracellular solute-binding protein family 5  36.99 
 
 
545 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4730  extracellular solute-binding protein  34.86 
 
 
537 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 
561 aa  295  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  35.51 
 
 
545 aa  294  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  35.6 
 
 
559 aa  294  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1253  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.4 
 
 
554 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0351  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.4 
 
 
554 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3019  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.4 
 
 
554 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2903  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  34.4 
 
 
554 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>