More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3590 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 908 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  42.95 
 
 		 903 aa  689    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  42.18 
 
 		 891 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 915 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.77 
 
 		 934 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 926 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  42.89 
 
 		 906 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  41.92 
 
 		 930 aa  678    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  42.74 
 
 		 924 aa  651    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  41.9 
 
 		 934 aa  654    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  39.67 
 
 		 942 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  42.33 
 
 		 932 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  40.82 
 
 		 929 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  40.53 
 
 		 936 aa  644    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 926 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  41.04 
 
 		 896 aa  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  41.47 
 
 		 896 aa  673    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  60.12 
 
 		 965 aa  1073    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  40.96 
 
 		 906 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.99 
 
 		 893 aa  701    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  42.48 
 
 		 903 aa  676    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 941 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  60.17 
 
 		 972 aa  1057    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 903 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 892 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  40.83 
 
 		 923 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  40.45 
 
 		 903 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  53.67 
 
 		 953 aa  941    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 915 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  43.16 
 
 		 891 aa  686    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 936 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 902 aa  639    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 926 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  41.52 
 
 		 915 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 892 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  43.38 
 
 		 892 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.72 
 
 		 939 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  41.4 
 
 		 930 aa  688    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  42.33 
 
 		 932 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  41.89 
 
 		 893 aa  695    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 905 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 939 aa  636    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  41.62 
 
 		 915 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.14 
 
 		 892 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 947 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 926 aa  683    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  41.54 
 
 		 910 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  100 
 
 		 936 aa  1883    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 929 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  43.8 
 
 		 928 aa  675    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  40.83 
 
 		 923 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  42.22 
 
 		 932 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 934 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  40.83 
 
 		 923 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  41.52 
 
 		 915 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 903 aa  674    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 939 aa  647    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 928 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  42.36 
 
 		 922 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.85 
 
 		 946 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 892 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  42.8 
 
 		 912 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  43.73 
 
 		 888 aa  685    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 939 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 928 aa  644    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  41.77 
 
 		 917 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 943 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 926 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  39.54 
 
 		 949 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 902 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  42.04 
 
 		 911 aa  666    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.14 
 
 		 893 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  40.82 
 
 		 931 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  41.82 
 
 		 922 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  41.25 
 
 		 923 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  41.09 
 
 		 927 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 926 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 932 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 934 aa  633  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  40.75 
 
 		 978 aa  634  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40 
 
 		 922 aa  634  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  41.08 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 928 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  40.61 
 
 		 928 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 928 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  40.61 
 
 		 976 aa  631  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  40.57 
 
 		 928 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 922 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 928 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 928 aa  631  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 921 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 928 aa  632  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 951 aa  631  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  40.23 
 
 		 922 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 928 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>