46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3500 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  87.4 
 
 
247 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2597  hypothetical protein  81.61 
 
 
115 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  28.96 
 
 
348 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  30.32 
 
 
345 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  30.85 
 
 
345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  28.05 
 
 
361 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  24.68 
 
 
1195 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  24.22 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  24.1 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  24.09 
 
 
861 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  35.9 
 
 
801 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  29.72 
 
 
329 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0733  hypothetical protein  25.5 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.97575  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  33.08 
 
 
803 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  20.79 
 
 
875 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2970  hypothetical protein  27.56 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.145955 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  45.45 
 
 
811 aa  52.8  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  25.52 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  19.17 
 
 
340 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  27.21 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  32.56 
 
 
783 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1099  hypothetical protein  21.76 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  30.83 
 
 
795 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  28.28 
 
 
773 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  21.47 
 
 
340 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  30.28 
 
 
362 aa  49.7  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  35.8 
 
 
793 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  28.57 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  33.33 
 
 
843 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  25.08 
 
 
859 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  27.49 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  23.55 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  27.83 
 
 
854 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  37.8 
 
 
792 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  30.07 
 
 
298 aa  46.2  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  20.78 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  28.07 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  26.89 
 
 
795 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  20.18 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  31.39 
 
 
447 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  25.93 
 
 
862 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  34.67 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  30.08 
 
 
339 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>