More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2945 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
474 aa  947    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  58.04 
 
 
491 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  54.33 
 
 
507 aa  487  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  56.53 
 
 
463 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  44.49 
 
 
462 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  45.61 
 
 
458 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  42.27 
 
 
445 aa  354  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  41.68 
 
 
447 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  37.22 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  36.36 
 
 
467 aa  332  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  38.53 
 
 
445 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  38.7 
 
 
448 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  38.7 
 
 
448 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  42.95 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  35.95 
 
 
467 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  38.83 
 
 
464 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  38.38 
 
 
474 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  38.63 
 
 
466 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  37.64 
 
 
476 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  40.66 
 
 
469 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  38.83 
 
 
463 aa  267  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  32.56 
 
 
437 aa  236  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.39 
 
 
449 aa  236  9e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  32.83 
 
 
445 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  31.39 
 
 
451 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  31.39 
 
 
451 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  33.19 
 
 
447 aa  226  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.1 
 
 
455 aa  226  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  32.39 
 
 
444 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  36.52 
 
 
455 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  31.69 
 
 
446 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.12 
 
 
452 aa  223  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  31.87 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  31.87 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  33.56 
 
 
441 aa  217  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  34.35 
 
 
744 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.31 
 
 
445 aa  209  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  30.84 
 
 
443 aa  205  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  38.21 
 
 
456 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  33.77 
 
 
412 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  35.38 
 
 
430 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  33.78 
 
 
411 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  33.11 
 
 
418 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  35.34 
 
 
416 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.89 
 
 
490 aa  179  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  34.95 
 
 
410 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  33.94 
 
 
418 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  31.91 
 
 
472 aa  178  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  33.77 
 
 
424 aa  176  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  32.98 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  37.11 
 
 
421 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  33.91 
 
 
429 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  34.64 
 
 
417 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.14 
 
 
445 aa  167  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  35.47 
 
 
394 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  32.9 
 
 
415 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  33.12 
 
 
420 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  33.92 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  33.86 
 
 
425 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  33.03 
 
 
413 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  32.96 
 
 
425 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  31.79 
 
 
408 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  31.79 
 
 
408 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  31.79 
 
 
408 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  32.64 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  31.05 
 
 
408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  28.19 
 
 
470 aa  130  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  22.88 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2273  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  25.82 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.183699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2626  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  22.93 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000210646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3631  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  23.19 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0359  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.48 
 
 
476 aa  66.6  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2371  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  26.19 
 
 
493 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  25.69 
 
 
473 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  27.37 
 
 
491 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2619  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  26.64 
 
 
488 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000807518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0736  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetases  28.32 
 
 
486 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240874  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0839  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  25.81 
 
 
465 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.58965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.39 
 
 
471 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2414  Mur ligase family protein  25.42 
 
 
401 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00339863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1438  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.84 
 
 
449 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0135  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  26 
 
 
569 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2014  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  22.46 
 
 
483 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  24.41 
 
 
493 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000060186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0351  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  24.57 
 
 
457 aa  60.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate ligase  25.17 
 
 
492 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0408  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  34.01 
 
 
470 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2502  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.89 
 
 
457 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1635  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2,6- diamin opimelate/D-alanyl-D-alanylligase  25.63 
 
 
455 aa  60.1  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0844  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.99 
 
 
468 aa  60.1  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.952175 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0182  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.17 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0120552  normal  0.632755 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  30.28 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0518  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  26.13 
 
 
490 aa  60.1  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2816  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.89 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0725  UDP-N-acetylmuramate  25.27 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.729179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0531  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.83 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0298409  normal  0.578451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0355  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.09 
 
 
484 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05211  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  27.21 
 
 
460 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0078  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.66 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0464  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.300994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>