More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0176 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  100 
 
 
327 aa  645    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  40 
 
 
279 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  36.5 
 
 
320 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  36.5 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.19 
 
 
333 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  36.88 
 
 
253 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  38.04 
 
 
276 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  34.73 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.34 
 
 
263 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.27 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.91 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.27 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.27 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  33.14 
 
 
751 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.91 
 
 
263 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  34.42 
 
 
276 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.91 
 
 
263 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.31 
 
 
260 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.91 
 
 
263 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.99 
 
 
263 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.46 
 
 
320 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.14 
 
 
311 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  34.69 
 
 
748 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  32.56 
 
 
734 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.68 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2340  alpha-beta hydrolase family esterase  33.66 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  34.47 
 
 
735 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.22 
 
 
760 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.34 
 
 
323 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30.5 
 
 
263 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  34.33 
 
 
707 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  33.11 
 
 
738 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.6 
 
 
275 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  34.47 
 
 
754 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  33.6 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.96 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.7 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  33.71 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.04 
 
 
263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  35.95 
 
 
738 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  33.07 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.21 
 
 
316 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  32.96 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  33.02 
 
 
750 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.87 
 
 
324 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  31.42 
 
 
252 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  32.35 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  32.26 
 
 
737 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  32.26 
 
 
738 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  33.66 
 
 
720 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  32.88 
 
 
300 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  33.12 
 
 
737 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  33.22 
 
 
738 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  33.22 
 
 
738 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  35.79 
 
 
813 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  34.01 
 
 
738 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  33.67 
 
 
736 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  32.26 
 
 
738 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  37.8 
 
 
263 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  32.26 
 
 
310 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  41.01 
 
 
293 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  33.11 
 
 
767 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  34.38 
 
 
241 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  39.08 
 
 
257 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  32.89 
 
 
739 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.16 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  35.69 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  29.19 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  31.37 
 
 
667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.45 
 
 
728 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.38 
 
 
748 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  37.23 
 
 
314 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  30.56 
 
 
776 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  33.88 
 
 
250 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  34.49 
 
 
796 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  34.21 
 
 
262 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  35.07 
 
 
803 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  35.07 
 
 
803 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.78 
 
 
250 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  34.72 
 
 
798 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  35.07 
 
 
803 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.25 
 
 
311 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  31.82 
 
 
737 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  34.87 
 
 
312 aa  119  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  29.41 
 
 
735 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  31.8 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30.96 
 
 
315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  29.33 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  34.95 
 
 
746 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  29.33 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.43 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  29.58 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  32.61 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  29.33 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  30.71 
 
 
317 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.07 
 
 
323 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  37.62 
 
 
323 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  34.66 
 
 
804 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  33.78 
 
 
852 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  30.32 
 
 
341 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>