More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1476 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  100 
 
 
346 aa  716    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  72.97 
 
 
364 aa  528  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  70.47 
 
 
364 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  66.28 
 
 
364 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  65.59 
 
 
364 aa  467  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
377 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
386 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
364 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
378 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
371 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.76 
 
 
419 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
395 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
374 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  27.13 
 
 
357 aa  113  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
398 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
388 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
367 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
371 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
403 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
370 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
361 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
377 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
398 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
390 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
391 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
391 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
403 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
371 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
426 aa  106  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
387 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  27.86 
 
 
379 aa  106  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
382 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3093  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
361 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  29.62 
 
 
342 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  35.68 
 
 
411 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
396 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
366 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.89 
 
 
401 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
372 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
386 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 
414 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
385 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
371 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
399 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
383 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
409 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
370 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  27.71 
 
 
371 aa  103  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.92 
 
 
408 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
360 aa  103  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
401 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
395 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
388 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
355 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
366 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
385 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
418 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
414 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
381 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
376 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
374 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.92 
 
 
366 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
358 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
374 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
389 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
380 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
398 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
453 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
452 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
401 aa  99.8  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.86 
 
 
373 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
704 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.17 
 
 
372 aa  99.4  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
366 aa  99.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
384 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
417 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
396 aa  98.6  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.18 
 
 
415 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
350 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>