More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0932 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 599 aa  678    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 600 aa  669    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 604 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 590 aa  670    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  80.1 
 
 		 604 aa  1022    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 605 aa  1256    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 590 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 606 aa  668    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 607 aa  658    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 593 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 590 aa  672    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 604 aa  643    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  82.8 
 
 		 605 aa  1038    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  79.26 
 
 		 608 aa  1004    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 590 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 591 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  56.85 
 
 		 619 aa  674    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 614 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 593 aa  720    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 595 aa  691    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  77.34 
 
 		 608 aa  980    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 605 aa  640    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  86 
 
 		 601 aa  1062    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 625 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 604 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  80.74 
 
 		 606 aa  1026    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 604 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 595 aa  633  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 590 aa  631  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 590 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 590 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 595 aa  633  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 591 aa  631  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 597 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 590 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 590 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 588 aa  628  1e-179  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 591 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 591 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 591 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 595 aa  623  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 609 aa  622  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 595 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 594 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 623 aa  609  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 623 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 596 aa  610  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 596 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 596 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 601 aa  601  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 600 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 581 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 603 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 592 aa  547  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 597 aa  546  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 597 aa  542  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 588 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 592 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 583 aa  530  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 593 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 583 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 598 aa  525  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 589 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 590 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 583 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 598 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 600 aa  519  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 583 aa  521  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 586 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 598 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 595 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 589 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 591 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 591 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 591 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 591 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 591 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 591 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 591 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 591 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04440  aspartyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 592 aa  515  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.462018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 591 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 600 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 594 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 590 aa  511  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 617 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 589 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 598 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 592 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 608 aa  512  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 591 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 593 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0600  aspartyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 592 aa  506  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 591 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>