127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7204 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  100 
 
 		 105 aa  210  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  61.29 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  61.29 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  61.29 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  59.79 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  61.29 
 
 		 110 aa  120  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  64.29 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  62.64 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  62.64 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  60 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  57.78 
 
 		 106 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  61.36 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  66.67 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  61.63 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  56.67 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  53.4 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  63.53 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  62.35 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  60.71 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  58.59 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  60 
 
 		 99 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  59.38 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  59.76 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  49.52 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  62.65 
 
 		 102 aa  103  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  63.86 
 
 		 98 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  59.04 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  59.3 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  61.45 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  54.55 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  59.76 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  60.71 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  60.71 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  56.41 
 
 		 98 aa  93.6  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  50 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  41.57 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.33 
 
 		 358 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.03 
 
 		 384 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.06 
 
 		 381 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 358 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.68 
 
 		 375 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  36.76 
 
 		 375 aa  50.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.76 
 
 		 375 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.46 
 
 		 358 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  29.63 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  30.85 
 
 		 399 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 		 373 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  31.4 
 
 		 456 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.93 
 
 		 393 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.62 
 
 		 377 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  37.8 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  36.62 
 
 		 375 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  39.68 
 
 		 359 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 373 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  37.33 
 
 		 333 aa  47.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 		 374 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.03 
 
 		 379 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 		 379 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 373 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 379 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1162  shikimate kinase / chorismate mutase  40 
 
 		 266 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 		 373 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.31 
 
 		 396 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 		 383 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  27.71 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 379 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 379 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  27.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  40.54 
 
 		 375 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 		 379 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 		 383 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  26.51 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 		 383 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 383 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 		 379 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  32.05 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  36.05 
 
 		 381 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  35.35 
 
 		 372 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  40.79 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  34.12 
 
 		 386 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04880  monofunctional chorismate mutase  35.21 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.12 
 
 		 386 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.12 
 
 		 386 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>