More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5771 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
413 aa  787    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  47.61 
 
 
405 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  47.21 
 
 
405 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  47.52 
 
 
405 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  47.52 
 
 
405 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  47.52 
 
 
405 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  47.09 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  47.65 
 
 
404 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  47.15 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  49.58 
 
 
398 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  46.77 
 
 
395 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  48.49 
 
 
398 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  44.7 
 
 
393 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  46.88 
 
 
400 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  46.88 
 
 
400 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  47.12 
 
 
400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  49.29 
 
 
388 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  46.38 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  46.38 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  50.26 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  51.27 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  47.46 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  49.5 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  49.25 
 
 
399 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  46.63 
 
 
401 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  48.86 
 
 
401 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  46.89 
 
 
400 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  44.96 
 
 
407 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  48.95 
 
 
402 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  43.99 
 
 
396 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  45.91 
 
 
402 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.85 
 
 
399 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.85 
 
 
399 aa  245  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.85 
 
 
399 aa  245  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  46.44 
 
 
402 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.21 
 
 
399 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  46.53 
 
 
408 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.74 
 
 
399 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.95 
 
 
399 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  40.1 
 
 
385 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.69 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.63 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  45.03 
 
 
402 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  43.95 
 
 
405 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  43.24 
 
 
416 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  42.86 
 
 
406 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  44.48 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.62 
 
 
399 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  44.48 
 
 
402 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  38.31 
 
 
426 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 
447 aa  222  9e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  43.96 
 
 
413 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.17 
 
 
394 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.44 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.73 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  32.74 
 
 
406 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 
399 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  32.74 
 
 
406 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.98 
 
 
394 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.71 
 
 
394 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.71 
 
 
394 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.71 
 
 
394 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 
413 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.71 
 
 
394 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  32.31 
 
 
403 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.72 
 
 
411 aa  208  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.74 
 
 
395 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.24 
 
 
394 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  37.3 
 
 
402 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  38.42 
 
 
404 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  38.03 
 
 
394 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  38.03 
 
 
394 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  38.17 
 
 
394 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  38.03 
 
 
394 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 
399 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 
403 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  40.1 
 
 
407 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  39.9 
 
 
399 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 
423 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.27 
 
 
383 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.52 
 
 
399 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  37.63 
 
 
399 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  38.46 
 
 
415 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 
397 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  35.79 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  39.33 
 
 
405 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
408 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  32.29 
 
 
392 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
389 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.47 
 
 
400 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 
391 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  38.71 
 
 
425 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 
389 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  37.31 
 
 
398 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  38.76 
 
 
433 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
419 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  47.27 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  38.38 
 
 
399 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  38.38 
 
 
405 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>