75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1535 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  63.01 
 
 		 176 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  57.14 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  52.33 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  32.2 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  32.56 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  33.61 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  25.48 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  33.96 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  37.8 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  54.55 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.2 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  30.22 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  28.9 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  47.06 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  22.93 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  22.93 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  22.93 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  22.93 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  22.93 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  22.29 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  55.77 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  54.35 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  34.13 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  29.03 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  30.91 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 125 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 103 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  31.46 
 
 		 199 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 118 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  26.55 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  26.86 
 
 		 179 aa  44.3  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 372 aa  44.3  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  21.47 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  32.05 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 179 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  26.7 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  32.05 
 
 		 107 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  28.41 
 
 		 316 aa  41.2  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0649  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 107 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 120 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 108 aa  41.2  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 121 aa  40.8  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>