More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1164 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 203 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  56.08 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  47.76 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  44.04 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  46.08 
 
 		 256 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  38.81 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  42.02 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  42.07 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  37.31 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  42.39 
 
 		 239 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  35.05 
 
 		 363 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.59 
 
 		 201 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  32.54 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  35.09 
 
 		 237 aa  99.4  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  36.78 
 
 		 471 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  38.83 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 		 237 aa  98.6  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  38.1 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  33.14 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  38.51 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  32.34 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.81 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  37.7 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.68 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  32.94 
 
 		 256 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  29.87 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  27.67 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  34.46 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  38.98 
 
 		 473 aa  92.8  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  32.78 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  34.44 
 
 		 245 aa  91.7  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  35.24 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  32.68 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  32.68 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  32.49 
 
 		 227 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  32.68 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.54 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.88 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.13 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  33.7 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  33.7 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  32.47 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  33.77 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  32.32 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2475  SNARE associated Golgi protein  35.94 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  32.47 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  28.35 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  28.35 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  36.57 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  31.01 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  28.35 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  28.35 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  28.35 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  29.38 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.89 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  35.82 
 
 		 212 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  32.6 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  32.6 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  32.6 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  33.77 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  32.6 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  32.48 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  31.02 
 
 		 220 aa  87.8  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  34.74 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  28.89 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.89 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  28.89 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  32.4 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  28.89 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  30.67 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  28.89 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  28.89 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  86.3  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  31.89 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  38.6 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  30.67 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  33.11 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  29.17 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  31.85 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  32.04 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  27.69 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  30.41 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  33.99 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  28.44 
 
 		 249 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  27.6 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0859  SNARE associated Golgi protein  32.62 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.33 
 
 		 286 aa  84.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  34.44 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  34.44 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  34.44 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>