282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4297 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  31.4 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  31.2 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  29.6 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  29.44 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  28.74 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  30.12 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  30.12 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  30.12 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  28.8 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  29.05 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  30.12 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  30.12 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  30.12 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  30.12 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  28.4 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  30.43 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  30.52 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  29.25 
 
 		 295 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  29.25 
 
 		 295 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  29.25 
 
 		 295 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  30.04 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  29.25 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  32.58 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  30.24 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  28.46 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  28.46 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  30.58 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  29.32 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  27.5 
 
 		 318 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  27.78 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  29.03 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  29.03 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  29.54 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  28.98 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  37.67 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  29.54 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  29.24 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  29.54 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  29.54 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  28.93 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  28.28 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  28.4 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  27.94 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  28.69 
 
 		 235 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  28.31 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  26.42 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  25.21 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  31.4 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  25.74 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  26.19 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  26.87 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  27.31 
 
 		 235 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  29.11 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  27.43 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  29.05 
 
 		 308 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  29.11 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  24.89 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  29.96 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  29.51 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  26.48 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  27.69 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  26.48 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  28.51 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  26.14 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  28.11 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  26.14 
 
 		 306 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  26.97 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  28.14 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  24.79 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  28.74 
 
 		 340 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.13 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  26.78 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.42 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  28.22 
 
 		 314 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  28.63 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  28.27 
 
 		 321 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  29.05 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.17 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  24.79 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  29.75 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.35 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  28.35 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  25.51 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  28 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  27.27 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  33.87 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  28.09 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  30.33 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  26.94 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  25.42 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  27.08 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  33.87 
 
 		 278 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  29.27 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0579  protein of unknown function DUF45  34.48 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>