85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3376 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3376  putative lipoprotein  100 
 
 		 406 aa  838    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00752899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  24.03 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  26.49 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  26.24 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  23.26 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  24.32 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  25.68 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  22.39 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  22.68 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  25.27 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  30.53 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  24.85 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  24.12 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  23.53 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  22.81 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  29.44 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  22.81 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  23.59 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  25.81 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  29.79 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  23.59 
 
 		 456 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  31.65 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  28.28 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  24.59 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  28.99 
 
 		 470 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  25 
 
 		 491 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  26.12 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  26.37 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  23.92 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  25.31 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  22.22 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  24.43 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  22.73 
 
 		 482 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  30.14 
 
 		 348 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  24.63 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  31.58 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  23.94 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  27.15 
 
 		 459 aa  49.7  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  25.13 
 
 		 479 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  26.24 
 
 		 354 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  25.37 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  30.71 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  29.14 
 
 		 798 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2217  integral membrane protein-like  31.4 
 
 		 174 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  29.29 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  25.59 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  25.56 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  24.43 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  25.56 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  22.39 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  24.41 
 
 		 542 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  30.08 
 
 		 493 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  29.69 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  27.82 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  23.66 
 
 		 475 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  25.55 
 
 		 445 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  24.19 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  24.16 
 
 		 481 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  24.63 
 
 		 479 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  24.63 
 
 		 479 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  34.19 
 
 		 196 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  29.17 
 
 		 445 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  37.93 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  29.55 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  22.6 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  25.94 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  23.88 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  24.15 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  24 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  23.13 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  31.25 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  23.13 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  32.93 
 
 		 151 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  28.36 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  28.68 
 
 		 191 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  30.84 
 
 		 191 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  30.3 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  30.3 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  30.3 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>