22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2217 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2217  integral membrane protein-like  100 
 
 		 174 aa  345  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0894  integral membrane protein-like protein  38.86 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.532451  normal  0.108912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0840  integral membrane protein-like protein  39.55 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0842  hypothetical protein  36.31 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0071  hypothetical protein  32.02 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1117  hypothetical protein  25.79 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.5096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3376  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 406 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00752899  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0718  hypothetical protein  26.32 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00551171  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1148  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  30.94 
 
 		 445 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3054  hypothetical protein  28.83 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  32.65 
 
 		 423 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2071  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.93 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3508  hypothetical protein  27.62 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  30.18 
 
 		 436 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  29.79 
 
 		 479 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  32.48 
 
 		 476 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1785  hypothetical protein  29.52 
 
 		 192 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127834  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1401  hypothetical protein  26.37 
 
 		 192 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.537695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1409  hypothetical protein  33 
 
 		 177 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  29.56 
 
 		 476 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>