233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0014 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0014  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  47.78 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  47.5 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  42.36 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  43.84 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  45.77 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  45.77 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  45.77 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  46.83 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  46.83 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  46.83 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  46.83 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  46.83 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  43.22 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  42.71 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  42.71 
 
 		 204 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  43.78 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03739  predicted elongation factor  47.5 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  47.5 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03688  hypothetical protein  47.5 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  40.5 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  42.71 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  42.71 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4311  hypothetical protein  47.5 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.521499  normal  0.36951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4215  hypothetical protein  47.5 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000733457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  41.71 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4371  hypothetical protein  47.5 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4264  hypothetical protein  47.5 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  42.71 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4192  hypothetical protein  47.5 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121716  normal  0.896932 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0022  hypothetical protein  42.21 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.977624  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  46.04 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  42.29 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  41.21 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  40.91 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  39.9 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  46.43 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  39.71 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0023  hypothetical protein  43.6 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  40.4 
 
 		 204 aa  151  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  44.51 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  39 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0017  hypothetical protein  39.44 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.44 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  35.64 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  35.5 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.79 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  37.24 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0605  hypothetical protein  48.39 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  35.15 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  37.16 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1317  hypothetical protein  38.42 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000207664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  32.46 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.68 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  32.95 
 
 		 198 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  35.08 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  37.77 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  34.43 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  32.81 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2535  hypothetical protein  40.22 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000701111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  33.87 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  34.05 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  32.67 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  35.12 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  33.84 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  31.21 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  33.33 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.74 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  36.16 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  30.73 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  28.85 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  33.51 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  34.41 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  32.97 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  37.16 
 
 		 239 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.07 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  30.81 
 
 		 211 aa  104  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2969  hypothetical protein  41.38 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.34 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  34.72 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  34.44 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  33.98 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  34.76 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  34.2 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  32.29 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  34.76 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  40 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0682  hypothetical protein  33.69 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  34.76 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  34.76 
 
 		 303 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  34.76 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  28.35 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  33.16 
 
 		 195 aa  101  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  34.57 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>