More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0863 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0863  putative sensor histidine kinase  100 
 
 
420 aa  814    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3457  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.47 
 
 
443 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.46 
 
 
241 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.47 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.06 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  34.06 
 
 
516 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.51 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.62 
 
 
539 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.62 
 
 
539 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.62 
 
 
539 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  36.28 
 
 
610 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  24.66 
 
 
553 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  24.66 
 
 
553 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  24.66 
 
 
553 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.55 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  24.66 
 
 
553 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  27.61 
 
 
611 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.66 
 
 
552 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6388  histidine kinase  30.88 
 
 
482 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582712  normal  0.0179261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
526 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
557 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.22 
 
 
552 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  24.22 
 
 
552 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  23.32 
 
 
552 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.19 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  24.22 
 
 
552 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  24.22 
 
 
552 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.51 
 
 
555 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  24.22 
 
 
552 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  34.91 
 
 
600 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  29.92 
 
 
573 aa  69.7  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0701  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
545 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.310619 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  26.06 
 
 
496 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  30.84 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
683 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
464 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.34 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.051036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.28 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
646 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  34.91 
 
 
506 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  36.11 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
919 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  33.88 
 
 
620 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
525 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.22 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
525 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  30.84 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1196  ATPase domain-containing protein  26.27 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  29.92 
 
 
573 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.26 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  28.44 
 
 
462 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
1151 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.39 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
1140 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
391 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1089  histidine kinase  26.96 
 
 
353 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1620  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 
559 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.96029  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  25.38 
 
 
533 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4395  nitrogen regulation protein NR(II)  27.97 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0028  nitrogen regulation protein NR(II)  24.42 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4221  nitrogen regulation protein NR(II)  25 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2360  histidine kinase  34.13 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.95 
 
 
525 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  25 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  32.79 
 
 
622 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1191  histidine kinase  33.04 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.0000100343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4190  nitrogen regulation protein NR(II)  24.42 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.497456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0334  sensor histidine kinase  38.46 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.4 
 
 
679 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0026  nitrogen regulation protein NR(II)  24.42 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.968773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.62 
 
 
543 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4217  nitrogen regulation protein NR(II)  26.76 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732813  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  37.62 
 
 
543 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4238  nitrogen regulation protein NR(II)  26.76 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.893304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  37.62 
 
 
543 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  35.85 
 
 
716 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
803 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
620 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
571 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.83 
 
 
519 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4334  nitrogen regulation protein NR(II)  26.76 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  24.42 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  37.62 
 
 
543 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3362  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
641 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.610194  normal  0.575745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
566 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>