More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3006 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  99.64 
 
 		 552 aa  1128    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 552 aa  1132    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  98.91 
 
 		 552 aa  1123    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  99.64 
 
 		 552 aa  1127    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  99.82 
 
 		 552 aa  1130    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  87.55 
 
 		 553 aa  966    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  87.73 
 
 		 553 aa  968    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  87.73 
 
 		 553 aa  969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  99.64 
 
 		 552 aa  1128    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  86.8 
 
 		 553 aa  968    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  99.64 
 
 		 552 aa  1128    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0058  sensor kinase DpiB  41.86 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736152  normal  0.965676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0057  sensor kinase DpiB  41.67 
 
 		 552 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0425242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0060  sensor kinase DpiB  41.86 
 
 		 552 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.64 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0058  sensor kinase DpiB  41.48 
 
 		 552 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  0.361929 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0059  sensor kinase DpiB  41.67 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.39 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.74 
 
 		 534 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.58 
 
 		 534 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.26 
 
 		 531 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.81 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  37.31 
 
 		 565 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.34 
 
 		 553 aa  329  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  33.33 
 
 		 541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003319  sensor kinase CitA  37.09 
 
 		 539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  34.13 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 534 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 536 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 536 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 536 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.14 
 
 		 536 aa  280  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 536 aa  279  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  31.78 
 
 		 533 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  34.01 
 
 		 536 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.4 
 
 		 532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  31.84 
 
 		 533 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.6 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.74 
 
 		 537 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.14 
 
 		 537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.43 
 
 		 537 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.67 
 
 		 540 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.14 
 
 		 537 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.14 
 
 		 537 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.83 
 
 		 537 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.89 
 
 		 526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  30.27 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  30.81 
 
 		 533 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  30.46 
 
 		 534 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  30.46 
 
 		 534 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  30.08 
 
 		 534 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  30.08 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  29.69 
 
 		 534 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 529 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  29.89 
 
 		 534 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  29.68 
 
 		 529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  29.68 
 
 		 529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  30.88 
 
 		 528 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  30.08 
 
 		 534 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 529 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  30.35 
 
 		 529 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  30.46 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.46 
 
 		 529 aa  230  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.99 
 
 		 543 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.65 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.6 
 
 		 525 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.19 
 
 		 529 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  30.75 
 
 		 542 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.55 
 
 		 538 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.38 
 
 		 540 aa  206  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  28.95 
 
 		 538 aa  206  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  29.76 
 
 		 537 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.54 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  29.08 
 
 		 533 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.92 
 
 		 555 aa  203  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  29.48 
 
 		 537 aa  203  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.62 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.79 
 
 		 539 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  30.56 
 
 		 542 aa  200  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  29.22 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.74 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.79 
 
 		 539 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.79 
 
 		 539 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.5 
 
 		 542 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.14 
 
 		 541 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  27.44 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.03 
 
 		 556 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  27.26 
 
 		 543 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.49 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  27.49 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  27.49 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  27.49 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.61 
 
 		 546 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.86 
 
 		 527 aa  187  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  27.07 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  27.07 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>