More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3457 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3457  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
443 aa  886    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0863  putative sensor histidine kinase  33.33 
 
 
420 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.64 
 
 
543 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.65 
 
 
275 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.25 
 
 
303 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.77 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2632  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.39 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.32 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.52 
 
 
540 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  28.46 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.7 
 
 
526 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.19 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.52 
 
 
549 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  25.76 
 
 
533 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.11 
 
 
460 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  27.45 
 
 
537 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0538  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.08 
 
 
290 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.19 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  28.45 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  28.08 
 
 
538 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.64 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.87 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.04 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.35 
 
 
540 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.79 
 
 
546 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.89 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.89 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.89 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.09 
 
 
525 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.57 
 
 
529 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1551  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573003  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.22 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
536 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
536 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1579  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.02 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000246185  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  24.44 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  24.44 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  26.22 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.64 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.6 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.94 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  26.94 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.98 
 
 
519 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  26.94 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  26.94 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  26.94 
 
 
543 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  26.78 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  30.56 
 
 
534 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  30.56 
 
 
536 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  26.89 
 
 
542 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  30.56 
 
 
536 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  26.11 
 
 
534 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.88 
 
 
553 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  26.94 
 
 
543 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.59 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  22.84 
 
 
553 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  30.56 
 
 
533 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.68 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0343689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.59 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  23.59 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.55 
 
 
553 aa  66.6  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  23.59 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  30.56 
 
 
534 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  23.59 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  23.59 
 
 
552 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  25.78 
 
 
534 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  30.09 
 
 
536 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  25.78 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  25.78 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.64 
 
 
456 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  23.59 
 
 
552 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.89 
 
 
540 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  25.59 
 
 
887 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.78 
 
 
470 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  30.09 
 
 
533 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4130  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.16 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.16899  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  28.51 
 
 
529 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.37 
 
 
527 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
919 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  26.22 
 
 
534 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.02 
 
 
521 aa  64.7  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.47 
 
 
445 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1680  histidine kinase  28.45 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  22.34 
 
 
553 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  22.34 
 
 
553 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  24.26 
 
 
625 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  22.34 
 
 
553 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.09 
 
 
532 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50990  Nitrogen fixation regulatory protein, NifL  25.93 
 
 
519 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  26.05 
 
 
542 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  24.26 
 
 
625 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
1004 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.04 
 
 
534 aa  63.9  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
505 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 
526 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  27.46 
 
 
516 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  28.1 
 
 
543 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  24.89 
 
 
534 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0208  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 
708 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.832424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>