39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2269 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 442 aa  875    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1601  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.39 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00658825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1751  sensor histidine kinase VirS  32.73 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0035916  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1481  sensor histidine kinase VirS  33.8 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.73 
 
 		 342 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02250  histidine kinase  27.62 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  28.1 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 431 aa  93.6  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000246195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  27.09 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  30.1 
 
 		 248 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.33 
 
 		 242 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0582  signal transduction protein  30.37 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2647  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.75 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0430  ATP-binding region ATPase domain protein  23.11 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.23 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2346  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.23 
 
 		 609 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.600899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3457  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.32 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.95 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2545  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.23 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.290644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2641  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  19.87 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.94 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.91 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1814  ATP-binding region ATPase domain protein  22.38 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211625  normal  0.35963 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.43 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2125  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.56 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.145856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.12 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.88 
 
 		 470 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.21 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.25 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  24.24 
 
 		 516 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1650  signal transduction protein  23.95 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0538  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.84 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0863  putative sensor histidine kinase  29.94 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.17 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  24.24 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2632  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.28 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.17 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000677983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.32 
 
 		 241 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0471  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.81 
 
 		 225 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0687563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>