More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0543 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  98.72 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  53.65 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  54.94 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  49.36 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  46.81 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  46.81 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  46.38 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  45.96 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  45.96 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  45.96 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  45.96 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  45.96 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  45.96 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  41.28 
 
 		 300 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 242 aa  157  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  33.33 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  31.44 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 195 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 195 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  26.99 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 265 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 265 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.21 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.21 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.21 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.21 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.21 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.21 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.87 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  25.43 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  26.55 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>