More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00950 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  100 
 
 
713 aa  1478    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  43.42 
 
 
568 aa  465  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  42.69 
 
 
570 aa  464  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  42.13 
 
 
596 aa  451  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  33.5 
 
 
558 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  33.17 
 
 
561 aa  349  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  33.28 
 
 
561 aa  347  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  32.68 
 
 
561 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  32.68 
 
 
561 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  33.22 
 
 
561 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  32.75 
 
 
558 aa  337  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  32.47 
 
 
558 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.56 
 
 
553 aa  324  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  32.62 
 
 
555 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  33.93 
 
 
550 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  33.93 
 
 
550 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  33.93 
 
 
550 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  33.77 
 
 
550 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.28 
 
 
552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.58 
 
 
546 aa  306  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.58 
 
 
546 aa  306  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  33.33 
 
 
542 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  34 
 
 
560 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  33.17 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  32.28 
 
 
556 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  31.8 
 
 
556 aa  304  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  30.49 
 
 
549 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.22 
 
 
572 aa  289  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  31.09 
 
 
575 aa  283  8.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.65 
 
 
561 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.95 
 
 
553 aa  281  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.23 
 
 
558 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.14 
 
 
547 aa  272  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.59 
 
 
554 aa  267  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.82 
 
 
552 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.46 
 
 
546 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.66 
 
 
552 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.86 
 
 
550 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  27.64 
 
 
559 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  27.48 
 
 
559 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.62 
 
 
576 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62095  pyruvate decarboxylase (PDC6) (PDC3)  26.77 
 
 
623 aa  209  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  27.85 
 
 
549 aa  207  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.25 
 
 
557 aa  205  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.56 
 
 
545 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  26.58 
 
 
547 aa  200  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.85 
 
 
562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.68 
 
 
558 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  25.65 
 
 
543 aa  170  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  24.44 
 
 
541 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  25.91 
 
 
543 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  24.96 
 
 
543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  25.73 
 
 
545 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2896  indole-3-pyruvate decarboxylase (Indolepyruvatedecarboxylase)  32.51 
 
 
274 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  0.207962 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.02 
 
 
551 aa  154  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  24.5 
 
 
540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  24.5 
 
 
542 aa  146  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.68 
 
 
586 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  23.59 
 
 
555 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  25.41 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  23.06 
 
 
572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  24.72 
 
 
572 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  23.25 
 
 
560 aa  101  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.33 
 
 
563 aa  100  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.63 
 
 
559 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  21.32 
 
 
548 aa  97.4  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  23.26 
 
 
554 aa  96.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.52 
 
 
560 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  21.45 
 
 
562 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  21.45 
 
 
562 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  21.45 
 
 
562 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  21.45 
 
 
562 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.81 
 
 
581 aa  94.7  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  22.12 
 
 
550 aa  95.1  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  21.27 
 
 
562 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  21.79 
 
 
546 aa  94  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  23.01 
 
 
552 aa  93.6  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  21.96 
 
 
548 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  21.2 
 
 
546 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  21.2 
 
 
546 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.73 
 
 
556 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.73 
 
 
561 aa  93.6  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  21.2 
 
 
546 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  21.2 
 
 
546 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  22.16 
 
 
555 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  22.7 
 
 
546 aa  92.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  21.77 
 
 
561 aa  92  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  22.4 
 
 
556 aa  92  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  23.56 
 
 
563 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.45 
 
 
581 aa  92  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  22.7 
 
 
546 aa  91.3  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  22.7 
 
 
546 aa  91.3  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  22.7 
 
 
546 aa  91.3  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  21.86 
 
 
548 aa  91.3  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  21.43 
 
 
546 aa  90.9  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  22.7 
 
 
546 aa  90.9  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  22.7 
 
 
546 aa  90.9  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.88 
 
 
557 aa  90.9  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  22.7 
 
 
546 aa  90.9  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  22.7 
 
 
546 aa  90.9  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>