More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04700 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND04700  thiol-disulfide exchange intermediate, putative  100 
 
 
326 aa  671    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  30.63 
 
 
330 aa  135  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28263  thioredoxin  27.42 
 
 
338 aa  93.6  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135642  normal  0.918036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43143  predicted protein  36.72 
 
 
186 aa  84  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18389  predicted protein  30.26 
 
 
165 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0900015 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01160  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  50 
 
 
105 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  55 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  45.83 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01364  DUF1000 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09230)  31.37 
 
 
227 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.497419  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  41.18 
 
 
108 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  36.71 
 
 
109 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  45.31 
 
 
114 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  42.42 
 
 
165 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  33.94 
 
 
238 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  37.04 
 
 
106 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  40.62 
 
 
223 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50 
 
 
120 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  48.33 
 
 
108 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  35.64 
 
 
189 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  45 
 
 
108 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  35.87 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  44.26 
 
 
110 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  43.28 
 
 
108 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  42.65 
 
 
110 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  40.48 
 
 
110 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  46.03 
 
 
109 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  46.03 
 
 
109 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  46.03 
 
 
140 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3801  Thioredoxin domain protein  43.86 
 
 
768 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  34.69 
 
 
136 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  46.03 
 
 
109 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  44.44 
 
 
147 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  42.25 
 
 
105 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  44.83 
 
 
285 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  34.44 
 
 
298 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  32.94 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  39.71 
 
 
110 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  39.36 
 
 
302 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  43.33 
 
 
104 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  39.68 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  34.33 
 
 
129 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  40.3 
 
 
145 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  41.79 
 
 
107 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  39.06 
 
 
106 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  43.64 
 
 
110 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  32.46 
 
 
119 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  46.67 
 
 
106 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  42.86 
 
 
110 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  43.64 
 
 
110 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  42.86 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  39.68 
 
 
109 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  41.27 
 
 
113 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  42.19 
 
 
110 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  33.71 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  40 
 
 
105 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  35.8 
 
 
104 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  35.8 
 
 
104 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  41.67 
 
 
116 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  35.8 
 
 
104 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  36.71 
 
 
120 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  41.27 
 
 
108 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  41.27 
 
 
110 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  41.07 
 
 
109 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.69 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  37.88 
 
 
119 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  38.46 
 
 
110 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  37.68 
 
 
103 aa  56.6  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  35.14 
 
 
109 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  29.41 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  43.33 
 
 
107 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  37.21 
 
 
106 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  38.1 
 
 
139 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  37.5 
 
 
107 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  41.67 
 
 
105 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  46.55 
 
 
108 aa  56.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  42.65 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  36.99 
 
 
113 aa  56.2  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  40.3 
 
 
107 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  31.4 
 
 
287 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  39.68 
 
 
109 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  39.39 
 
 
108 aa  56.2  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  42.11 
 
 
105 aa  56.2  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  44.07 
 
 
105 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  44.44 
 
 
144 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  31.43 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  44.44 
 
 
144 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  37.04 
 
 
104 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  41.67 
 
 
104 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  39.68 
 
 
280 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  30.34 
 
 
107 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  37.5 
 
 
133 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  41.67 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  38.89 
 
 
107 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>