More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0025 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  100 
 
 
461 aa  920  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  100 
 
 
461 aa  920  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  97.18 
 
 
461 aa  855  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.53 
 
 
435 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  37.56 
 
 
435 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  34.88 
 
 
471 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  34.14 
 
 
457 aa  239  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1813  sodium/dicarboxylate symporter  33.76 
 
 
456 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1200  sodium:dicarboxylate symporter  33.92 
 
 
464 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  33.26 
 
 
457 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4469  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  214  4e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.72174e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4267  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  214  4e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  214  4e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.16588e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3988  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  214  4e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.04073e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  214  4e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  6.96352e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4100  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 
464 aa  213  5e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.69232e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0063  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.46 
 
 
462 aa  213  5e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00246087  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  30.87 
 
 
468 aa  213  6e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  33.48 
 
 
463 aa  213  8e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4377  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.26 
 
 
464 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.78657e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4358  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.26 
 
 
464 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4324  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.26 
 
 
464 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  4.95156e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0876  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.26 
 
 
464 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.42898e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0130  sodium/dicarboxylate symporter family protein  33.11 
 
 
457 aa  209  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  3.47492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0682  sodium:dicarboxylate symporter  34.07 
 
 
465 aa  209  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  6.82862e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2975  sodium:dicarboxylate symporter  32.6 
 
 
463 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0873777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  32.1 
 
 
463 aa  206  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1851  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  31.26 
 
 
463 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0377279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  31.02 
 
 
450 aa  204  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.20299e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  33.86 
 
 
480 aa  202  1e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.19973e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1685  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.13 
 
 
463 aa  201  2e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.24446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5360  Sodium:dicarboxylate symporter  31.03 
 
 
463 aa  201  2e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1795  sodium:dicarboxylate symporter  31.13 
 
 
463 aa  201  2e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.13 
 
 
463 aa  201  2e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0324  sodium:dicarboxylate symporter  32.43 
 
 
455 aa  201  2e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  30.14 
 
 
428 aa  201  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1462  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.83 
 
 
463 aa  199  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.726866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1810  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.61 
 
 
463 aa  198  2e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1974  sodium:dicarboxylate symporter family  31.61 
 
 
463 aa  198  2e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1903  sodium:dicarboxylate symporter  31.61 
 
 
463 aa  198  2e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  33.08 
 
 
463 aa  198  2e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2447  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  31.61 
 
 
463 aa  198  2e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1913  sodium:dicarboxylate symporter  31.61 
 
 
463 aa  198  2e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0453037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01698  predicted transporter  31.61 
 
 
463 aa  198  2e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.770973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01686  hypothetical protein  31.61 
 
 
463 aa  198  2e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.709568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1950  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.4 
 
 
463 aa  197  4e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0365  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  32.35 
 
 
451 aa  197  4e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0981  sodium:dicarboxylate symporter  30.74 
 
 
463 aa  197  5e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.216579  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1417  sodium:dicarboxylate symporter family  31.26 
 
 
463 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977711  normal  0.0168529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5004  sodium:dicarboxylate symporter  33.16 
 
 
463 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143079  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5131  sodium:dicarboxylate symporter  33.42 
 
 
463 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0442  sodium:dicarboxylate symporter  32.66 
 
 
462 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  3.81157e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1449  sodium:dicarboxylate symporter family  31.26 
 
 
463 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0431  sodium:dicarboxylate symporter  32.66 
 
 
462 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.63479e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1434  sodium:dicarboxylate symporter family  31.26 
 
 
463 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0334  sodium:dicarboxylate symporter  31.24 
 
 
463 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1900  sodium:dicarboxylate symporter  33 
 
 
464 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1714  sodium:dicarboxylate symporter  31.69 
 
 
463 aa  191  3e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.424207  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2024  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.84 
 
 
463 aa  191  3e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.546812  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2193  sodium:dicarboxylate symporter  33.08 
 
 
464 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1380  sodium:dicarboxylate symporter  30.28 
 
 
462 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1316  sodium:dicarboxylate symporter  30.57 
 
 
462 aa  189  6e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.539428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  32.25 
 
 
444 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2123  sodium:dicarboxylate symporter  32.08 
 
 
463 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00153943  decreased coverage  0.000144884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  29.51 
 
 
441 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  31.95 
 
 
441 aa  181  3e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0754  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family protein  32.65 
 
 
463 aa  180  4e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.7297  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4249  sodium:dicarboxylate symporter  30.13 
 
 
462 aa  180  5e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  32.21 
 
 
413 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  30.73 
 
 
427 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  29.12 
 
 
480 aa  175  1e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.58413e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  31.69 
 
 
417 aa  175  2e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  31.23 
 
 
416 aa  175  2e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  32.11 
 
 
417 aa  174  2e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 
419 aa  174  4e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl652  putative sodium-glutamate symporter  29.53 
 
 
585 aa  174  4e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 
419 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 
419 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  32.02 
 
 
419 aa  173  6e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2153  sodium:dicarboxylate symporter  30.63 
 
 
470 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  27.63 
 
 
442 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.32104e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 
416 aa  170  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  33.77 
 
 
410 aa  169  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  6.77504e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  29.95 
 
 
416 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  29.61 
 
 
500 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  32.65 
 
 
417 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  28.04 
 
 
437 aa  167  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  32.64 
 
 
419 aa  167  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  32.82 
 
 
417 aa  166  6e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  32.82 
 
 
417 aa  166  6e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  29.97 
 
 
439 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  29.55 
 
 
476 aa  166  1e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  26.43 
 
 
444 aa  166  1e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  30.08 
 
 
426 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 
440 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28490  Na+/H+ dicarboxylate symporter  31.28 
 
 
495 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.47 
 
 
440 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.96305e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  28.4 
 
 
437 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.82 
 
 
436 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  6.93951e-06  decreased coverage  2.85663e-09 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2831  sodium:dicarboxylate symporter  30.18 
 
 
477 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>