More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0981 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0981  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
463 aa  909    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.216579  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  58.48 
 
 
457 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  59.01 
 
 
457 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  57.89 
 
 
471 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1813  sodium/dicarboxylate symporter  58.89 
 
 
456 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1851  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  56.9 
 
 
463 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0377279  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1685  sodium:dicarboxylate symporter family protein  57.27 
 
 
463 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.24446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1795  sodium:dicarboxylate symporter  57.27 
 
 
463 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2123  sodium:dicarboxylate symporter  56.52 
 
 
463 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00153943  decreased coverage  0.000144884 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  57.05 
 
 
463 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1449  sodium:dicarboxylate symporter family  56.9 
 
 
463 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1434  sodium:dicarboxylate symporter family  56.9 
 
 
463 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2024  sodium:dicarboxylate symporter family protein  56.47 
 
 
463 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.546812  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1417  sodium:dicarboxylate symporter family  56.68 
 
 
463 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977711  normal  0.0168529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1950  sodium/dicarboxylate symporter family protein  55.6 
 
 
463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01698  predicted transporter  55.27 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.770973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1913  sodium:dicarboxylate symporter  55.27 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0453037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1903  sodium:dicarboxylate symporter  55.27 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1810  sodium/dicarboxylate symporter family protein  55.27 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2447  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  55.27 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01686  hypothetical protein  55.27 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.709568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1462  sodium/dicarboxylate symporter family protein  55.17 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.726866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1974  sodium:dicarboxylate symporter family  55.39 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  55.48 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4249  sodium:dicarboxylate symporter  53.7 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1380  sodium:dicarboxylate symporter  56.67 
 
 
462 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379298  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1714  sodium:dicarboxylate symporter  56.25 
 
 
463 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.424207  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  55.75 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1316  sodium:dicarboxylate symporter  57.14 
 
 
462 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.539428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4324  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 
464 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000495156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 
464 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000696352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4377  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 
464 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000178657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3988  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 
464 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.04073e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4100  sodium:dicarboxylate symporter  53.63 
 
 
464 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 
464 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000216588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4267  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 
464 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5360  Sodium:dicarboxylate symporter  54.16 
 
 
463 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4469  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.85 
 
 
464 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2975  sodium:dicarboxylate symporter  53.98 
 
 
463 aa  449  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0873777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0876  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.63 
 
 
464 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000242898  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4358  sodium:dicarboxylate symporter family protein  53.63 
 
 
464 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2193  sodium:dicarboxylate symporter  56.32 
 
 
464 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0334  sodium:dicarboxylate symporter  55.06 
 
 
463 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1900  sodium:dicarboxylate symporter  56.32 
 
 
464 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0682  sodium:dicarboxylate symporter  51.43 
 
 
465 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  55.77 
 
 
463 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5131  sodium:dicarboxylate symporter  55.53 
 
 
463 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5004  sodium:dicarboxylate symporter  55.53 
 
 
463 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143079  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0365  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  53.12 
 
 
451 aa  411  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0063  sodium:dicarboxylate symporter family protein  48.46 
 
 
462 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00246087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0442  sodium:dicarboxylate symporter  49.65 
 
 
462 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000381157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0431  sodium:dicarboxylate symporter  49.65 
 
 
462 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000163479  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0130  sodium/dicarboxylate symporter family protein  44.7 
 
 
457 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000347492  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0324  sodium:dicarboxylate symporter  45.73 
 
 
455 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1461  sodium:dicarboxylate symporter  49.66 
 
 
451 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000388581  normal  0.0381632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1200  sodium:dicarboxylate symporter  43.63 
 
 
464 aa  365  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  44.26 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  41.99 
 
 
468 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0754  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family protein  47 
 
 
463 aa  349  5e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.7297  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2153  sodium:dicarboxylate symporter  46.48 
 
 
470 aa  342  5.999999999999999e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1803  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family  41.69 
 
 
448 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260998  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1500  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  41.69 
 
 
448 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000799891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1465  transporter dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family  41.46 
 
 
448 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361022  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1974  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  41.69 
 
 
448 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  hitchhiker  0.000000330732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1481  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family transporter  41.46 
 
 
448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175987  hitchhiker  0.00000339976 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.98 
 
 
435 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.19 
 
 
435 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  30.8 
 
 
461 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  30.8 
 
 
461 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  30.87 
 
 
461 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  29.38 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  32.92 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  30.96 
 
 
413 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  30.84 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  29.91 
 
 
428 aa  159  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  31.81 
 
 
416 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  31.37 
 
 
417 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  31.62 
 
 
417 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  30.94 
 
 
419 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  30.64 
 
 
417 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  31.81 
 
 
419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  31.28 
 
 
419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  31.28 
 
 
419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  30.57 
 
 
416 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  31.81 
 
 
419 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  31.09 
 
 
427 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  30.33 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  26.38 
 
 
440 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  30.14 
 
 
426 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  25.87 
 
 
447 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  27.15 
 
 
445 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  29.75 
 
 
444 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  26.46 
 
 
433 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  29.37 
 
 
479 aa  146  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.02362  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.19 
 
 
436 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  26.93 
 
 
432 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  30.75 
 
 
425 aa  143  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  30.42 
 
 
444 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  30.34 
 
 
480 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  27.17 
 
 
430 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>