More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2024 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01698  predicted transporter  95.46 
 
 		 463 aa  834    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.770973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1913  sodium:dicarboxylate symporter  95.46 
 
 		 463 aa  833    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0453037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1449  sodium:dicarboxylate symporter family  99.57 
 
 		 463 aa  908    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5131  sodium:dicarboxylate symporter  75.97 
 
 		 463 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1795  sodium:dicarboxylate symporter  83.59 
 
 		 463 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1950  sodium/dicarboxylate symporter family protein  95.25 
 
 		 463 aa  834    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  75.76 
 
 		 463 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1810  sodium/dicarboxylate symporter family protein  95.46 
 
 		 463 aa  833    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1974  sodium:dicarboxylate symporter family  95.68 
 
 		 463 aa  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1685  sodium:dicarboxylate symporter family protein  83.59 
 
 		 463 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.24446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1903  sodium:dicarboxylate symporter  95.46 
 
 		 463 aa  834    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2447  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  95.46 
 
 		 463 aa  834    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5360  Sodium:dicarboxylate symporter  80.52 
 
 		 463 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1380  sodium:dicarboxylate symporter  76.89 
 
 		 462 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  83.37 
 
 		 463 aa  755    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01686  hypothetical protein  95.46 
 
 		 463 aa  834    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.709568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1462  sodium/dicarboxylate symporter family protein  95.25 
 
 		 463 aa  835    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.726866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  79.91 
 
 		 463 aa  714    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0334  sodium:dicarboxylate symporter  76.19 
 
 		 463 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1434  sodium:dicarboxylate symporter family  99.57 
 
 		 463 aa  908    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5004  sodium:dicarboxylate symporter  75.76 
 
 		 463 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  80.13 
 
 		 463 aa  732    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1900  sodium:dicarboxylate symporter  81.25 
 
 		 464 aa  680    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1851  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  99.35 
 
 		 463 aa  907    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0377279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1316  sodium:dicarboxylate symporter  77.54 
 
 		 462 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.539428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2193  sodium:dicarboxylate symporter  81.03 
 
 		 464 aa  683    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2024  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 		 463 aa  910    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.546812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1417  sodium:dicarboxylate symporter family  99.35 
 
 		 463 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977711  normal  0.0168529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1714  sodium:dicarboxylate symporter  93.95 
 
 		 463 aa  804    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.424207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2123  sodium:dicarboxylate symporter  85.75 
 
 		 463 aa  764    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00153943  decreased coverage  0.000144884 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4249  sodium:dicarboxylate symporter  70.77 
 
 		 462 aa  606  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  58.95 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  59.61 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  59.69 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0365  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  63.74 
 
 		 451 aa  528  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1813  sodium/dicarboxylate symporter  57.55 
 
 		 456 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0981  sodium:dicarboxylate symporter  56.47 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2975  sodium:dicarboxylate symporter  56.3 
 
 		 463 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0873777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4377  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.79 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000178657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4324  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.79 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000495156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4100  sodium:dicarboxylate symporter  54.57 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4358  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.57 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0876  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.57 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000242898  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.57 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000696352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3988  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.57 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.04073e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.57 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4469  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.57 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4267  sodium:dicarboxylate symporter family protein  54.57 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0682  sodium:dicarboxylate symporter  50.32 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1461  sodium:dicarboxylate symporter  52.55 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000388581  normal  0.0381632 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0063  sodium:dicarboxylate symporter family protein  48.56 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00246087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0442  sodium:dicarboxylate symporter  51.03 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000381157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0431  sodium:dicarboxylate symporter  51.03 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000163479  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0130  sodium/dicarboxylate symporter family protein  44.91 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000347492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1500  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  45.8 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000799891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1465  transporter dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family  46.03 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.361022  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1803  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family  45.8 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1974  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  45.35 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  hitchhiker  0.000000330732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1481  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family transporter  45.58 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175987  hitchhiker  0.00000339976 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0324  sodium:dicarboxylate symporter  45.15 
 
 		 455 aa  375  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1200  sodium:dicarboxylate symporter  43.41 
 
 		 464 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  43.86 
 
 		 480 aa  364  2e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2153  sodium:dicarboxylate symporter  47.8 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0754  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family protein  46.5 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.7297  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  42.42 
 
 		 468 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  30.84 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  30.84 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.45 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  30.84 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.33 
 
 		 437 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  30.34 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.37 
 
 		 436 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  32.88 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  32.21 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  32.88 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  33.12 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  31.84 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  31.84 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  31.61 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  32.13 
 
 		 440 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  31.84 
 
 		 436 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  34.62 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  32.52 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  31.65 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  31.17 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  32.27 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  31.49 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  31.49 
 
 		 419 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  32.82 
 
 		 441 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  31.49 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  30.2 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  31.49 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  31.4 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  31.04 
 
 		 427 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  30.02 
 
 		 450 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  31.78 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  31.12 
 
 		 426 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  31.71 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  32.57 
 
 		 437 aa  180  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  29.8 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>