214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3503 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
287 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  41.1 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  40.91 
 
 
298 aa  231  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  40.13 
 
 
300 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  41.91 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  41.84 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  38.04 
 
 
273 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
314 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  29.35 
 
 
313 aa  142  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  25.9 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  30.85 
 
 
311 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  28.16 
 
 
316 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  30.27 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  32.5 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  27.56 
 
 
330 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  27.24 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.35 
 
 
310 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
330 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  24.03 
 
 
358 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.84 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.43 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.38 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  27.32 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
332 aa  85.5  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.75 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.31 
 
 
672 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  29.55 
 
 
625 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  23.89 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.54 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  23.51 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  30.22 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  25 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  22.91 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  26.43 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.69 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  24.9 
 
 
342 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.57 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  29.33 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  24.53 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  23.91 
 
 
214 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  23.28 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  23.28 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  22.22 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1188  methyltransferase type 12  27.75 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222476  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.56 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  32.74 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  32.74 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  32.74 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  32.14 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  32.74 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  31.25 
 
 
229 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  33.04 
 
 
229 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  22.71 
 
 
281 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  24.03 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  33.04 
 
 
229 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  26.12 
 
 
447 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  21.17 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  26.12 
 
 
447 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0402  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.49 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.272999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  21.84 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
1177 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  21.01 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  23.79 
 
 
354 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
1177 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  22.97 
 
 
574 aa  56.2  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.5 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  30.97 
 
 
229 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  27.97 
 
 
323 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
572 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  26.2 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  23.11 
 
 
607 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  23.42 
 
 
575 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0386  hypothetical protein  24.31 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.669351  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  31.5 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
248 aa  52.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.17 
 
 
346 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  31.96 
 
 
228 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
996 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
1340 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  24.4 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  22.32 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.01 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.67 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.44 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1162 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  23.86 
 
 
261 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  25.9 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>