More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0808 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0808  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000531821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  88.05 
 
 
225 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0763  DNA-binding response regulator  75.45 
 
 
224 aa  355  2.9999999999999997e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00370439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0978  DNA-binding response regulator  74.67 
 
 
226 aa  353  8.999999999999999e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1384  response regulator receiver  68.89 
 
 
226 aa  315  4e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  67.11 
 
 
224 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  66.67 
 
 
224 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  66.67 
 
 
224 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  66.81 
 
 
224 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1147  regulatory protein VanR  56.44 
 
 
224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0564  response regulator receiver  56 
 
 
223 aa  256  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.924373  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1360  transcriptional regulatory protein BaeR  57.27 
 
 
223 aa  256  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0966  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  57.27 
 
 
223 aa  256  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2094  response regulator receiver  55.2 
 
 
225 aa  249  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1135  transcriptional regulatory protein BaeR  55.51 
 
 
223 aa  247  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 
220 aa  240  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0494  two-component response regulator  52.21 
 
 
223 aa  233  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0464  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 
223 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1397  DNA-binding response regulator  51.53 
 
 
223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1277  DNA-binding response regulator  51.53 
 
 
223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112244  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2131  response regulator receiver  51.1 
 
 
223 aa  221  6e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 
224 aa  204  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 
241 aa  184  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0452  response regulator ompr  44.89 
 
 
222 aa  180  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 
245 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 
234 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 
234 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 
238 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.05 
 
 
226 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.61 
 
 
247 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  37.5 
 
 
234 aa  158  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  38.16 
 
 
236 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 
228 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 
234 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 
222 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 
234 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 
229 aa  155  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  38.16 
 
 
236 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  37.28 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  39.13 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 
230 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 
240 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 
240 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  37.89 
 
 
229 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2529  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 
232 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 
240 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  36.16 
 
 
247 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 
236 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 
224 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 
240 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  37.72 
 
 
240 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  37.99 
 
 
232 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 
231 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 
240 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 
232 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  34.68 
 
 
223 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 
226 aa  151  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 
246 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  36.24 
 
 
241 aa  151  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 
233 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 
239 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.23 
 
 
223 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 
226 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  34.55 
 
 
244 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  35.81 
 
 
241 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  34.55 
 
 
244 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.23 
 
 
223 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  34.23 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 
231 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  34.23 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 
230 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.78 
 
 
259 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 
234 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  33.63 
 
 
288 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  34.23 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 
261 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 
240 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  34.23 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
228 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  34.23 
 
 
223 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 
229 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 
230 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 
240 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 
240 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  37.99 
 
 
239 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 
230 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  35.24 
 
 
249 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.3 
 
 
232 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 
275 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 
233 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  35.71 
 
 
256 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  34.82 
 
 
226 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  36.49 
 
 
235 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
251 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  37.99 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.99 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  37.99 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  37.99 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>