More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0093 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1172  queuine tRNA-ribosyltransferase  79.3 
 
 
372 aa  636  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1432  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.7 
 
 
388 aa  674  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0681966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0093  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
376 aa  784  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0899534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0980  queuine tRNA-ribosyltransferase  80.59 
 
 
374 aa  628  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0584  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.08 
 
 
373 aa  605  1e-172  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0414152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1028  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.74 
 
 
373 aa  591  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1090  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.47 
 
 
373 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.50041  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0779  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.47 
 
 
373 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  72.51 
 
 
373 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.07 
 
 
372 aa  504  1e-142  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.19 
 
 
379 aa  399  1e-110  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.15 
 
 
375 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.52 
 
 
373 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.93 
 
 
372 aa  391  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 
372 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 
373 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.4 
 
 
370 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
371 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.46 
 
 
379 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
371 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.3 
 
 
373 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.79 
 
 
367 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
374 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.66 
 
 
373 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.05 
 
 
386 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.44 
 
 
355 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.38291e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
377 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.91 
 
 
370 aa  363  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 
407 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.99 
 
 
380 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.22 
 
 
392 aa  358  1e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.35 
 
 
392 aa  357  2e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
374 aa  357  2e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.85 
 
 
372 aa  357  2e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.86 
 
 
371 aa  357  2e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.22 
 
 
392 aa  356  4e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
375 aa  355  7e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.12 
 
 
392 aa  355  8e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.39 
 
 
374 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.67 
 
 
369 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 
370 aa  353  3e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.78979e-06  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.93 
 
 
391 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.8 
 
 
369 aa  352  6e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.7 
 
 
368 aa  352  6e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.12 
 
 
370 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.41 
 
 
394 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
384 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.2368e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 
367 aa  350  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
371 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.26 
 
 
371 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.3 
 
 
374 aa  349  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  47.85 
 
 
371 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.41 
 
 
380 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.41 
 
 
380 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.59 
 
 
374 aa  349  5e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
385 aa  349  6e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.44 
 
 
357 aa  349  6e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.97 
 
 
373 aa  348  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.56741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.52 
 
 
373 aa  349  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.7 
 
 
379 aa  347  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.51523e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.12 
 
 
377 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.42 
 
 
376 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.16 
 
 
379 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.68 
 
 
372 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
379 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 
368 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.65402e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.76 
 
 
379 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.92 
 
 
370 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.27 
 
 
376 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.27158e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.17 
 
 
381 aa  346  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  9.56702e-08  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.85 
 
 
383 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.56565e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.28432e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.70513e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.31 
 
 
382 aa  346  4e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.48017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.8864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.75969e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.10592e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.98 
 
 
384 aa  345  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.58 
 
 
367 aa  345  7e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0681  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
370 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.111123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.68 
 
 
376 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.95 
 
 
400 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.07 
 
 
370 aa  345  9e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.89 
 
 
395 aa  345  9e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.15 
 
 
399 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.85 
 
 
383 aa  344  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.22 
 
 
369 aa  344  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.75 
 
 
395 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.72 
 
 
376 aa  343  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 
377 aa  343  3e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.39 
 
 
375 aa  343  3e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.8 
 
 
388 aa  343  3e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.77 
 
 
376 aa  342  4e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40480  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.51 
 
 
371 aa  342  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1413  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.04 
 
 
371 aa  342  6e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.786795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 
376 aa  342  6e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>