84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2587 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  85.13 
 
 		 638 aa  1048    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  100 
 
 		 638 aa  1253    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5662  hypothetical protein  45.86 
 
 		 671 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4642  membrane protein-like protein  44.57 
 
 		 671 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3726  membrane protein-like  44.57 
 
 		 671 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.33 
 
 		 677 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  32.76 
 
 		 679 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1518  hypothetical protein  27.56 
 
 		 666 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4189  hypothetical protein  29.41 
 
 		 487 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.26 
 
 		 746 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  25.71 
 
 		 725 aa  60.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  25.11 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  27.97 
 
 		 733 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  22.86 
 
 		 717 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  26.27 
 
 		 702 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.27 
 
 		 763 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.57 
 
 		 763 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  24.68 
 
 		 717 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  24.31 
 
 		 372 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  24.66 
 
 		 372 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.38 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  24.66 
 
 		 372 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.89 
 
 		 740 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.33 
 
 		 719 aa  51.6  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  28.71 
 
 		 625 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.28 
 
 		 763 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.55 
 
 		 763 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.37 
 
 		 704 aa  50.8  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.08 
 
 		 764 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  26.79 
 
 		 758 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.08 
 
 		 764 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.25 
 
 		 653 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.08 
 
 		 764 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  26.79 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.41 
 
 		 679 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  29.18 
 
 		 361 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 682 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  26.79 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  26.79 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  26.79 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  26.79 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  26.79 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  26.79 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  25.3 
 
 		 883 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 655 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  25.12 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.9 
 
 		 851 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.07 
 
 		 806 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.12 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  25.12 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 655 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.12 
 
 		 655 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  28.91 
 
 		 633 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.91 
 
 		 633 aa  48.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.73 
 
 		 688 aa  48.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  23.29 
 
 		 371 aa  47.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.68 
 
 		 697 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  26.92 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25 
 
 		 655 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  30.61 
 
 		 679 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  28.48 
 
 		 534 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  27.6 
 
 		 376 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25 
 
 		 655 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  28.37 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.46 
 
 		 653 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.02 
 
 		 700 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  27.96 
 
 		 357 aa  45.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  30.18 
 
 		 676 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  30.18 
 
 		 676 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  27.49 
 
 		 357 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  27.49 
 
 		 357 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.59 
 
 		 680 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.29 
 
 		 680 aa  44.3  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  29.56 
 
 		 623 aa  43.9  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>