62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1518 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 666 aa  1326    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  52.5 
 
 		 679 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  51.68 
 
 		 677 aa  609  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  26.85 
 
 		 638 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  27.56 
 
 		 638 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4642  membrane protein-like protein  31.82 
 
 		 671 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3726  membrane protein-like  31.82 
 
 		 671 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5662  hypothetical protein  32.31 
 
 		 671 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4189  hypothetical protein  31.53 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  22.82 
 
 		 733 aa  63.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3835  YccS/YhfK family integral membrane protein  31.29 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3738  integral membrane protein YccS/YhfK family  29.75 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3772  hypothetical protein  29.75 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.503591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.75 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3664  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.75 
 
 		 695 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.423889  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  23.96 
 
 		 740 aa  54.3  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.8 
 
 		 806 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  26.88 
 
 		 721 aa  51.2  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  29.52 
 
 		 534 aa  50.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  24.03 
 
 		 764 aa  50.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 718 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 718 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  26.79 
 
 		 718 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  23.93 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.67 
 
 		 695 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.21 
 
 		 745 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.36 
 
 		 746 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.78 
 
 		 746 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  23.93 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  23.93 
 
 		 758 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21 
 
 		 764 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  23.93 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  23.93 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  23.93 
 
 		 758 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  23.93 
 
 		 758 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.63 
 
 		 764 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.63 
 
 		 764 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.9 
 
 		 719 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21 
 
 		 763 aa  47.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.33 
 
 		 660 aa  47.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  24.38 
 
 		 758 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  24.39 
 
 		 600 aa  47.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.08 
 
 		 730 aa  47  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.9 
 
 		 763 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  28.39 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  22.7 
 
 		 763 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  22.63 
 
 		 763 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  22.13 
 
 		 883 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4668  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.71 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0557749  normal  0.293941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.66 
 
 		 851 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3734  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.71 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3640  YccS/YhfK family integral membrane protein  24.66 
 
 		 696 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03161  hypothetical protein  26.71 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0228744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0354  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.71 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.550259  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03209  conserved inner membrane protein  26.71 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0251295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3828  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.71 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3555  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.71 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0354  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.71 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  24.89 
 
 		 721 aa  45.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  29.59 
 
 		 696 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.61 
 
 		 708 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0564  hypothetical protein  24.66 
 
 		 653 aa  43.9  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>