49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3529 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6832  putative ABC transporter substrate-binding protein  68.42 
 
 		 460 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0145789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  68.41 
 
 		 461 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1243  extracellular solute-binding protein  78.77 
 
 		 461 aa  742    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3687  extracellular solute-binding protein family 1  82.34 
 
 		 461 aa  788    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3529  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 458 aa  948    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00601615  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2928  extracellular solute-binding protein  63.58 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  33.55 
 
 		 486 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1413  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5713  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0822  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4328  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3646  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17089  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5337  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1258  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3960  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2892  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0502  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1619  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2097  twin-arginine translocation pathway signal  24.47 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.380982  hitchhiker  0.00612544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.19 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3322  twin-arginine translocation pathway signal  24.21 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3554  putative ABC transporter periplasmic-binding protein  24.74 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0531  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.89 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  23.4 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.4 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  23.4 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.15 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4117  ABC transporter substrate-binding protein, periplasmic component  27.4 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16072  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  19.68 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1442  ABC sugar transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.27 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0515377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>