More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3152 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  57.14 
 
 		 178 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  54.86 
 
 		 186 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  52.75 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  56.65 
 
 		 186 aa  184  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  56.65 
 
 		 186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  53.41 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  52.57 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  52.57 
 
 		 186 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  52.57 
 
 		 186 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  51.7 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  52.27 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  49.44 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  53.25 
 
 		 174 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  50.58 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  52.27 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  48.3 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  55.81 
 
 		 206 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  49.71 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  47.7 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  48.57 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  50.83 
 
 		 188 aa  157  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  45.93 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  51.16 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  46.24 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  47.51 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  54.65 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  55.29 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  54.65 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  54.65 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  54.65 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  54.65 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  54.65 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  54.65 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  53.89 
 
 		 172 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  53.8 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  50.57 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  44.38 
 
 		 182 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  42.86 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  42.86 
 
 		 222 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  41.01 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  47.49 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  44.69 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  42.35 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  41.24 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  40.68 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  43.53 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  39.88 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  39.11 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  33.91 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  39.15 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  38.73 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  40.53 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  40.46 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  39.56 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  39.56 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  39.41 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  38.55 
 
 		 190 aa  104  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  38.55 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  39.01 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  39.88 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  38.93 
 
 		 416 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  40.45 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  37.91 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  37.42 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  37.79 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  35.63 
 
 		 177 aa  98.2  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.84 
 
 		 180 aa  98.2  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  40 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  40.49 
 
 		 179 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.8 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.34 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.44 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  42.62 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.56 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  34.13 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  37.06 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  36.93 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  32.97 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.56 
 
 		 182 aa  94.4  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  34.46 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  36.69 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  33.89 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  35.39 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  37.23 
 
 		 191 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  35 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  38.51 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.51 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  38.51 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  37.5 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.51 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  38.51 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  33.89 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  38.51 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.51 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.51 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  35.88 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.09 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  41.81 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>