More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1581 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  100 
 
 
413 aa  828    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  75.06 
 
 
422 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  64.72 
 
 
429 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  40.15 
 
 
402 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.59 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  37.47 
 
 
400 aa  245  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.75 
 
 
420 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.84 
 
 
405 aa  239  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.08 
 
 
412 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  38.39 
 
 
423 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.55 
 
 
398 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.6 
 
 
407 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.83 
 
 
402 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.92 
 
 
410 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.96 
 
 
402 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.82 
 
 
388 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.66 
 
 
410 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  37.5 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  37.21 
 
 
417 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.15 
 
 
398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.93 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.36 
 
 
429 aa  213  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  37.72 
 
 
404 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.83 
 
 
436 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  36.43 
 
 
409 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  35.4 
 
 
412 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  32.49 
 
 
405 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.93 
 
 
411 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  34.9 
 
 
398 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  35.5 
 
 
439 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.3 
 
 
423 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  34.09 
 
 
415 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.34 
 
 
407 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.34 
 
 
407 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.34 
 
 
407 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.84 
 
 
408 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.35 
 
 
399 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  31.25 
 
 
411 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  33.33 
 
 
421 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.34 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.9 
 
 
410 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  37.7 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.63 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.42 
 
 
406 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.18 
 
 
412 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.81 
 
 
411 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  30.7 
 
 
411 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.97 
 
 
419 aa  199  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  31.25 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  30 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.75 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.64 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  30.81 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.12 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  33.92 
 
 
405 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.06 
 
 
411 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.56 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.42 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.83 
 
 
417 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.05 
 
 
411 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  34.86 
 
 
409 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  30.56 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  30.56 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  33.17 
 
 
417 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.3 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.3 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  36.13 
 
 
423 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.11 
 
 
400 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  34.84 
 
 
410 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.3 
 
 
411 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2032  cytochrome P450  34.6 
 
 
401 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0674155  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.16 
 
 
418 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  34.08 
 
 
417 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.67 
 
 
418 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  33.68 
 
 
408 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  39.24 
 
 
421 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  34.74 
 
 
414 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.57 
 
 
411 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  38.23 
 
 
423 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  33.58 
 
 
408 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  30.46 
 
 
411 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.59 
 
 
404 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  32.91 
 
 
413 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  31.71 
 
 
938 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.75 
 
 
407 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1769  cytochrome P450  31.99 
 
 
395 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  31.54 
 
 
400 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.14 
 
 
412 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  33 
 
 
387 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  33.93 
 
 
387 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  31.89 
 
 
412 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  30.46 
 
 
402 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.26 
 
 
405 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  30.79 
 
 
417 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  32.33 
 
 
406 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  32.62 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  32.92 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  36.08 
 
 
416 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  33.01 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>