More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1407 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 460 aa  934    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  61.32 
 
 		 459 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  61.47 
 
 		 456 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  52.63 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  54.15 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  48.67 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  50.11 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  47.25 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  45.03 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  50.66 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  45.03 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  48.87 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.47 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  45.75 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.49 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  44.37 
 
 		 479 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.3 
 
 		 472 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  44.71 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  41.41 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  41.1 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  43.96 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  44.93 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.47 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  40.79 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  43.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  42.55 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  45.15 
 
 		 465 aa  336  7e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  43.05 
 
 		 477 aa  335  9e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  42.98 
 
 		 465 aa  332  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  42.17 
 
 		 602 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  40.91 
 
 		 478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  43.6 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  43.98 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.16 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  40.39 
 
 		 470 aa  319  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 		 478 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  42.45 
 
 		 462 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  38.6 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.21 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  44.86 
 
 		 466 aa  302  8.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  40.49 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 		 476 aa  286  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.88 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  37.42 
 
 		 463 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.96 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  38.78 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.88 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  38.53 
 
 		 446 aa  223  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.82 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34.78 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  37.56 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.74 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.43 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  28.35 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.35 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  33.05 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.17 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  36.88 
 
 		 447 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  34.88 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  32.54 
 
 		 753 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  30.67 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.89 
 
 		 752 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  34.27 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.85 
 
 		 460 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.82 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 758 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.3 
 
 		 726 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.34 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  28.85 
 
 		 705 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.29 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  31.85 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  30.07 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  32.04 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.51 
 
 		 734 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  31.87 
 
 		 764 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.51 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  32.33 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  32.24 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.01 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  26.2 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  31.17 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  29.12 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 490 aa  154  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 		 474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.17 
 
 		 473 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  30.87 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.66 
 
 		 542 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.01 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  31.64 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 754 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  33.04 
 
 		 451 aa  146  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.4 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  26.32 
 
 		 448 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>