169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6586 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 158 aa  320  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  86.71 
 
 		 158 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  66.45 
 
 		 156 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  69.33 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  67.86 
 
 		 175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  68.57 
 
 		 175 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  71.43 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  66.15 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  64.29 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  66.94 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  66.94 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  66.94 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  67.74 
 
 		 160 aa  180  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  67.74 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  71.79 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  61.87 
 
 		 163 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  61.15 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  61.15 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  66.67 
 
 		 173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  64.66 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  58.46 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  64.35 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  60.15 
 
 		 163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  54.11 
 
 		 154 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  60.34 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  60.34 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  53.52 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  58.62 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  58.62 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  55.17 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  58.12 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  47.79 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  50 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  46.21 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  47.69 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  47.69 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  47.93 
 
 		 485 aa  130  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  51.75 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  49.55 
 
 		 120 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  45.3 
 
 		 271 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  50.48 
 
 		 117 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  40.32 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  39.64 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  37.84 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  38.74 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  37.96 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  38.74 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  42.99 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  41.44 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  41.44 
 
 		 120 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  39.82 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  39.82 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  36.28 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  33.03 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  38.46 
 
 		 122 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  36.94 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  34.26 
 
 		 118 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  40.91 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2175  PRC-barrel domain-containing protein  36.28 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  33.62 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  34.55 
 
 		 234 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  37.38 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  33.33 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  35.4 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  36.19 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  37.14 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  31.97 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  36.63 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  30.77 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  34.48 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  37.63 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  33.02 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  35.34 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  36.36 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  37.89 
 
 		 526 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  35.23 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  36.9 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  33.33 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  36.36 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  32.04 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  34.41 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  31.9 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  32.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  41.89 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  28.89 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1152  PRC-barrel protein  36.59 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  40.54 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  32.95 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  28.26 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  28.26 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1248  PRC-barrel domain protein  26.55 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1105  PRC-barrel domain-containing protein  26.55 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.25117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4076  PRC-barrel  31.71 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  35.63 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  40.45 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0934  PRC-barrel domain-containing protein  26.42 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.889607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  37.29 
 
 		 389 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  36.36 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3814  PRC-barrel  35.14 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>